黑龙江水稻品种空育131粒型QTL定位分析

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水稻对人类的意义非凡,因为水稻是一半世界人民的主食。也是在生物学研究中较理想的模式植物。水稻谷粒的长、宽、厚和长宽比都属于粒型性状,而且是重要的决定谷粒大小及外观和食味品质性状,是决定水稻产量的要素之一。这使它们成为了育种家们研究的热点性状。定位水稻粒型QTL找到主效QTL,然后进行精细定位是克隆粒型基因的前提,对改良稻米品质和提高水稻产量具有重要的理论意义。本实验在前人对粒型QTL定位与克隆的研究基础上利用空育131和珍汕97衍生的含150个株系的F2代群体为粒型初步定位试验材料,构建了一张含有140个SSR标记的遗传连锁图谱,进行了水稻粒型QTL初步定位与精细定位研究。共检测到30个与粒型性状相关的QTLs,分布于第1、第2、第3、第4、第5、第7、第8、第9、第10和第12染色体上。其中粒长11个、粒宽9个、粒厚3个、长/宽比7个。从检测到的粒长QTL中挑选了一个LOD值为10.8、贡献率高达22.8%的粒长QTL-qGL8-2,结合400个F3代群体的单株,最终将qGL8-2定位于第八号染色体短臂RM22780-RM22797之间的444.6kb物理距离内。同时从检测到的粒宽QTL中挑选了一个LOD值为8.46、贡献率高达15.2%的粒宽QTL-qGW9,结合480个F3代群体的单株,最终将qGW9定位于第九号染色体长臂RM215-RM24737之间的235.027kb物理距离内。具体研究结果如下:1.空育131粒长和长宽比显著低于珍汕97B,粒宽、粒厚显著高于珍汕97B,表现为明显的“短-宽-厚”。F2群体由亲本空育131的影响,粒长、粒宽和长宽比在群体中的多数个体性状值趋向于空育131。2.利用SPSS系列软件,对水稻粒型各性状间进行相关性分析,结果表明,在F2群体中,粒长与粒宽的相关性不显著,粒长与长宽比呈现极显著正相关,粒宽与粒厚呈极显著正相关,与长宽比呈极显著负相关。3.采用Mapmaker/3.0版本软件进行分子标记连锁图谱的构建,根据标记间的间隔和顺序,釆用ICIMapping4.0版本绘制遗传连锁图谱,构建了1张含有140个SSR标记,覆盖水稻全基因组1669.6cM,标记间平均距离为11.9cM的遗传图谱。4.采用Mapmaker/QTL1.1版本的软件检测QTL,共检测到控制粒长的QTLs 11个、粒宽QTLs 9个、粒厚QTLs 3个、长宽比QTLs 7个。分布于水稻的第1、2、3、4、5、7、8、9、10、12号染色体上。其中,qGL3、qGL8-2、qGW2-1、qGW9、qGT4、qL/W5-1、qL/W7-1是控制各性状的主效QTL。5.分别选取粒长和粒宽的主效QTL,qGL8-2和qGW9贡献率分别为22.8%和15.2%,挑选空育131与珍汕97的背景基于纯合目标区间为杂合的F2代单株自交获得F3代群体,将qGL8-2精细定位于8号染色体短臂在RM22780与RM22797两分子标记之间的444.6kb距离的区域内。将qGW9精细定位于第9号染色体长臂在RM215与RM24737两分子标记之间的235.027kb距离的区域内。
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