基于HCR反应开发GmSg-1基因可视化标记的研究

来源 :山西农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wuzhi1979
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大豆皂苷是大豆种子中重要的次生代谢产物之一,具有多种对人体有益的生理功能。大豆皂苷主要分为A类、DDMP类、B类和E类皂苷四类,而A类大豆皂苷在胚和子叶中分别占总皂苷含量的68.78%、43.17%。GmSg-1基因是合成A类皂苷的关键酶基因。因此从基因水平研究A类大豆皂苷定性定量可视化检測方法,对今后大豆种质资源A类皂苷的鉴定具有重要的意义,为大豆分子育种和功能性大豆产品的开发提供技术参考和理论依据。本研究利用HPLC-ESI-MS/MS法对68份山西大豆种质资源种子中大豆皂苷组成和含量进行测定,筛选出了大豆皂苷组成和含量特异的种质材料;对特异材料籽粒发育过程中Aa和Ab皂苷含量的积累动态和关键酶基因GmSg-1的表达进行研究;利用直接测序分析GmSg-1基因的多态性;探究基于HCR反应可视化检测关键酶基因GmSg-1多态性的可行性,从而达到从基因水平可视化快速检测A类皂苷的方法。通过本研究,主要结果如下:1.HPLC-ESI-MS/MS法检测供试68份大豆材料结果表明:供试材料主要分为Aa型、Ab型和AaAb型3种类型,胚和子叶中Aa、Ab皂苷含量存在较大的变异范围,Aa皂苷在胚和子叶中的变异范围分别为0.41-33.79 mg/g和0.21-8.39 mg/g,Ab皂苷在胚和子叶中的变异范围分别为0.85-44.96mg/g和0.26-11.09 mg/g。2.晋遗30大豆籽粒不同发育时期GmSg-1基因相对表达量呈现先增后减的趋势,与晋遗30大豆籽粒发育过程中Ab含量的变化趋势基本一致。3.利用直接测序法对Aa和Ab型大豆材料中的GmSg-1基因序列进行检测,共检测到19个SNP位点,其中10个SNP位点引起氨基酸变异。4.GmSg-1基因开放性阅读框为60-1442 bp,设计出HCR法检测GmSg-1基因多态性的两对探针GAa1、GAa2和GAb1、GAb2;摸索出该反应最佳体系为:Tris-HCl溶液pH为7.20、KCl浓度为110mmol/L、探针的浓度为1.5pmol/L,反应时间2h,显色后最佳观察时间为10 min。5.利用HCR法检测大豆材料,发现PCR扩增GmSg-1基因目标片段92 bp效果最佳,并分别对Aa型、Ab型和AaAb型大豆材料进行可视化检测,HCR法检测结果与表型的结果一致,且特异性好。6.制作可视化检测A类大豆皂苷的基因芯片。此方法具有灵敏度高、快速、简单等优点。
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