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本试验以12月龄两种饲养条件下(放牧和舍饲)苏尼特羊脂肪组织(背最长肌,尾脂、肾脂)和瘤胃液作为试验材料,利用实时荧光定量PCR法、气相质谱联用(GC-MS)和高通量测序技术,测定两种饲养方式下脂肪组织中脂肪酸代谢基因的表达和脂肪酸含量以及瘤胃菌群结构。研究不同饲养方式下脂肪组织中SCD、FADS1、FADS2和elove5基因的表达量和脂肪酸的含量以及瘤胃菌群的差异,并分析了脂肪酸含量和脂肪酸代谢基因与瘤胃菌群结构三者之间的相互关系。结果表明:通过分析脂肪组织中脂肪酸的含量可知,在舍饲组中辛酸(C8:0)的含量显著高于放牧组,在背最长肌和尾脂中癸酸(C10:0)的含量放牧组显著高于舍饲组;在储能脂肪(尾脂和肾脂)中亚油酸(C18:2)的含量放牧组显著高于舍饲组;放牧组中亚麻酸(C18:3)的含量显著高于舍饲组;放牧条件下更有利于脂肪组织中EPA(C20:5)和DHA(C22:6)的沉积。储能脂肪(尾脂和肾脂)更有利于饱和脂肪酸的沉积,肌肉中更有利于多不饱和脂肪酸的沉积。通过分析脂肪组织中脂肪酸代谢基因的表达量可知,舍饲组中SCD基因表达量显著高于放牧组;在背最长肌和肾脂中FADS1和FADS2基因舍饲组中表达量高于放牧组;在储能脂肪(尾脂和肾脂)中elove5舍饲组的表达量高于放牧组。SCD和elove5基因在尾脂中的表达量显著高于背最长肌和尾脂,FADS1和FADS2基因在背最长肌和肾脂中的表达量显著高于尾脂。对脂肪酸代谢基因表达量与脂肪酸含量相关性分析可知,FADS2基因表达量与EPA(C20:5)呈显著正相关;在尾脂和肾脂中FADS1基因的表达与EPA(C20:5)成正相关;在背最长肌中SCD基因的表达量与EPA(C20:5)和DHA(C22:6)呈显著负相关。通过分析不同饲养方式下门和属水平瘤胃菌群结构发现,放牧组中厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度显著低于舍饲组;而拟杆菌属(Bacteroides)的丰度显著高于舍饲组。对瘤胃菌群结构与脂肪酸含量相关性分析可知,瘤胃中纤维杆菌门(Fibrobacteres)的高丰度有助于背最长肌和尾脂中EPA(C20:5)的沉积,会减少降低DHA(C22:6)的沉积;纤维杆菌门还有利于储能脂肪(尾脂和肾脂)中油酸(C18:1)的沉积;肾脂中花生四烯酸(C20:4)和DHA(C22:6)的含量与拟杆菌门丰度呈正相关,但与厚壁菌门的丰度呈显著负相关。亚麻酸(C18:3)的沉积与丁酸弧菌属(Butyrivibrio)的相对丰度呈显著负相关;拟杆菌属相对丰度提高对脂肪组织中的多不饱和脂肪酸的沉积有促进作用。