酵母双杂交RRS系统中婴幼儿小肠组织全长cDNA文库的构建及筛选

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cxz2004
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景轮状病毒(rotavirus,RV)是导致全世界婴幼儿严重腹泻病的常见病原之一,每年可导致大约50万患儿死亡。无论发达国家还是发展中国家,RV的感染率和发病率都很高。因此迫切需要开发有效的疫苗和治疗策略来对抗病毒。而这些研究的基础又需要从根本上认识病毒作用于宿主细胞的分子机制。RV感染细胞的第一个关键步骤是病毒与被感染细胞表面的病毒受体结合。由于RV受体在宿主细胞上数量较少、性质复杂以及技术方法的局限性,其性质迄今不清。全长cDNA文库构建、测序和功能注释是了解生物体结构和功能的一种重要方法之一,它有助于鉴定其基因组序列中的外显子-内含子的边界,分析基因编码区和理解基因在转录和翻译水平的功能,是分析人类基因表达图谱、功能和结构的重要资源。文库筛选作为一种获取未知功能基因的手段,对于研究病毒作用于人体的分子机制起着非常重要的作用。酵母双杂交技术自创立以来已成为研究蛋白质之间相互作用的重要方法之一。传统的酵母双杂交方法所研究的蛋白质间相互作用是在细胞核内完成的,而近年来在此基础之上发展起来的酵母双杂交衍生系统---Ras募集系统(RRS),能够将蛋白质的相互作用定位于细胞膜上,更具备了灵敏度高、假阳性少等突出优点。RRS的应用原理为:酵母温度敏感株由于缺乏鸟苷酸交换因子(GEF)cdc25-2,而不能将外来信号传递给膜上的Ras蛋白,致使该种突变株在36℃不能存活;如果人为引入正常的GEF(Ras蛋白),并使得GEF能与膜足够接近,则可弥补这一缺陷,激活Ras信号途径,使酵母细胞能够在36℃生长。目的在本研究中,我们构建一个婴幼儿小肠组织的全长cDNA文库并将其插入RRS系统中的pUra-MΔpolyA载体,构建成猎物载体,将其与本课题组前期构建好的RV外壳蛋白VP4诱饵载体pMet425-Myc-Ras-VP4共转化酵母温度敏感菌株cdc25-2,通过RRS筛选文库中与RVVP4相互作用的蛋白质分子,探寻轮状病毒与肠道宿主细胞相互作用的分子机制。方法1.从婴幼儿小肠组织中提取总RNA,并纯化mRNA,反转录合成第一、二链,连接EcoRI人工接头,分级分离后,除去小于500bpcDNA片段,与pUra-MΔpolyA连接后,CaCl2法转化感受态细胞DH5α,测定文库大小并EcoRI/XhoI双酶切鉴定插入cDNA片段的大小。2.将诱饵载体pMet425-Myc-Ras-VP4与猎物载体pUra-MΔpolyA-cDNA共转化酵母温度敏感菌株cdc25-2,通过改变培养基的营养成分及生长温度,去除可能的假阳性结果,筛选出与RVVP4相互作用的蛋白质分子。结果1.成功构建含有6×107重组子的婴幼儿小肠组织全长cDNA文库,插入片段的大小范围在0.5-2 kb之间,平均长度1.5kb。2.通过Ras募集系统,筛选出阳性克隆,序列测定尚在进行中。结论1.首次构建了一个婴幼儿小肠组织全长cDNA文库,并验证了插入片段大小符合进一步筛选所需,库容量亦足够大,是一个高质量的文库。2.利用RRS筛选系统筛选出了婴幼儿小肠组织全长cDNA文库中可能与RV外壳蛋白VP4相互作用的受体蛋白。
其他文献
透明质酸合成酶3(Hyaluronan synthase 3,HAS3),是一个参与透明质酸合成的酶分子,在上皮形成和肿瘤转移等过程中起重要作用。为了进一步深入研究HAS3基因的转录调控机制,本研究克隆鉴定了HAS3基因的启动子。首先应用5’ RACE(rapid amplification of cDNA ends,cDNA末端快速扩增)技术鉴定了HAS3基因的转录起始位点,发现了丰度和转录起始
学位
学位
目的:研究ALU自身的RNA聚合酶III启动子对RNA聚合酶II转录的影响,探讨RNA聚合酶II转录ALU的生理功能。方法:(1)将Alu全基因序列插入pcDNA3.1载体的CMV启动子的下游,构建重组质粒pcDNA3.1-ALU;(2)转染293细胞,提取细胞总RNA,RT-PCR筛选稳定表达ALU的克隆;(3)western-blot法检测稳定表达PCDNA3.1-ALU293细胞PKR的磷酸
学位
目的:通过构建包含脯氨酸精氨酸抗菌肽(proline-arginine rich 39-amino acid peptide,PR-39)的慢病毒载体,转染兔骨髓间充质干细胞(bone mesenchymal stem cells, BMSC),并检测其在BMSC中的表达及抗菌活性。方法:PCR扩增目的基因,连接入慢病毒载体质粒pGC-FU中,与包装质粒pHelper1.0、pHelper2.0在
目的:应用RNAi文库建立一种筛选HBV复制相关基因的方法,筛选参与HBV复制的基因,为探讨HBV复制的机理,开发抗乙肝病毒新药提供新的靶点。方法:(1)建立并验证筛选策略:构建HBx-siRNA及HBs-siRNA并感染HepG2.2.15细胞,MEIA法检测细胞上清中HBsAg,HBeAg的表达量,定量RT-PCR检测细胞上清中HBV DNA及细胞内cccDNA的含量,FACS检测细胞表面HB
在深化教育改革进程中,以"立德树人"为指导思想的教学构建,成为小学英语教学改革的重要内容。为全面落实英语学科教学目标,坚持"立德树人",在传授文化知识的过程中,以人为本,培养学生良好的道德品质。本文立足"立德树人"思想,分析了小学英语教学实践中立德树人思想的价值及原则,并在此基础之上,从英语教材资源挖掘、课堂科学管理和教学模式创新等方面,具体论述了"立德树人"教育思想在小学英语教学中的实践策略。