创新活动是中小企业在激烈竞争的市场环境中生存和发展的必经之路,由于中小企业自身的原因和创新活动的高风险性,政府的支持在中小企业进行创新过程的不同阶段发挥着重要作用。财政政策和税收优惠都对中小企业自主研发有正向的促进作用,但是不同地域的宏观经济发展水平和政府的扶持力度都对政策效应有不同程度的影响。近年来,安徽省政府为鼓励中小企业自主创新,提高了政府科技投入的比例。本文以在深圳证券交易所中小板上市的安徽省中小企业为研究对象,通过构建模型,分析了财税政策鼓励中小企业自主创新的影响,并从适合中小企业自身特点的角度出发,提出鼓励中小企业创新能力的对策,为安徽省政府在今后的政策选择上提供参考。本文首先,界定了中小企业概念,分析了中小企业自主创新的重要性,阐述了中小企业自主创新的理论基础,有内生增长理论、技术创新理论和政府干预理论,为政府支持中小企业自主创新提供理论依据。其次,通过对现行财税政策鼓励安徽省中小企业自主创新的梳理,剖析了安徽省政府鼓励中小企业自主创新政策存在的缺陷,未能充分发挥财政政策和税收优惠对中小企业自主创新的促进作用。本文重点分析了安徽省政府鼓励中小企业自主创新的财税政策研究,以深圳证券交易所中小板上市的安徽省中小企业为样本,采用2011年到2015年的面板数据,借鉴前人的研究方法,在指标体系的确定上,选取和中小企业自主研发进行创新相关的变量,通过对数据的分析处理,建立符合条件的固定效应模型,分析政府直接资助和税收优惠对样本企业自主研发投入强度的影响,通过对样本企业的描述性统计,得出所取变量的内在特征,如样本企业研发成本的集中趋势和技术人员分布的离散程度等。并通过模型检验,分析具体财政政策和税收政策对中小企业自主创新的影响。根据模型实证结果,政府接资助和税收优惠对中小企业自主创新投入具有显著影响,并且政府直接资助的贡献程度更大。并结合安徽省现状,提高财税政策对安徽省中小企业自主研发政策效用,提出有针对性的建议。根据实证结果提出适当的政策建议,首先,要重视技术人员的作用,建立有专门性的个人税收优惠制度。其次,提高政府对研发直接投入的深度和广度,扩大政府资助的方式和种类。再次,要完善税收优惠机制的过程,充分调动税收优惠的普惠功能并加强对研发创新过程的政策优惠。还要加大政府对中小企业的融资支持。最后,尽管税收政策和财政政策各有利弊,也要充分结合每种政策的优点,使得财税政策对中小企业自主创新的扶持效果达到最大。