INTS10基因遗传变异与乙肝病毒感染结局的关联研究

来源 :广东药科大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:szj188
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目的:1.探讨环境因素对乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染结局的影响。2.探讨INTS10基因遗传变异对HBV感染结局的影响。3.探讨INTS10基因遗传变异与环境因素之间的交互作用对HBV感染结局的影响。方法:采用病例-对照研究方法,收集乙肝相关肝癌者(Hepatocellular Carcinoma,HCC)、慢性乙肝病毒感染者(Chronic HBV infection,CH)和乙肝病毒自限性清除者(Hepatitis B Virus Spontaneous Recovery,SR)作为研究对象,设立两个比较组:CH vs.SR比较组和HCC vs.CH比较组。应用标签SNP结合既往GWAS研究结果的方法选择与HBV感染有潜在关联的INTS10基因遗传变异,系统分析遗传变异和环境因素(吸烟、饮酒、恶性肿瘤家族史)对HBV感染结局的影响。应用TaqMan-PCR技术进行基因型检测;采用?2检验比较环境因素和基因型在各组之间的分布差异;采用Logistic回归模型分析环境因素对HBV感染结局的影响;采用Logistic回归模型和随机森林模型分析遗传变异对HBV感染结局的影响;采用遗传风险评分方法分析遗传变异的累积效应对HBV感染结局的影响;分别采用Logistic回归模型和非线性混合效应模型分析遗传变异与环境因素的交互作用对HBV感染结局的影响。结果:1.本研究采用病例-对照研究方法,纳入HCC 737例、CH 750例和SR 750例,组成两个比较组:CH vs.SR比较组和HCC vs.CH比较组。环境因素影响作用的分析结果显示,吸烟、饮酒和恶性肿瘤家族史均为乙肝相关肝癌的独立危险因素(OR=6.04,95%CI=4.73-7.72;OR=3.93,95%CI=3.12-4.95;OR=3.73,95%CI=2.75-5.05)。2.遗传变异影响作用的分析结果显示,在CH vs.SR比较组中,显性模型下rs4268139的突变与慢性HBV感染相关(P=0.049),与rs4268139的CC基因型携带者相比,CG/GG基因型携带者患慢性HBV感染的风险增加(OR=1.25,95%CI=1.01-1.57)。在加性模型下rs4268139的突变也与慢性HBV感染相关(OR=1.23,95%CI=1.01-1.51,P=0.044)。在HCC vs.CH比较组中,rs7000921的TC基因型与乙肝相关肝癌的发病相关(P=0.030),与rs7000921的TT基因型携带者相比,TC基因型携带者的乙肝相关肝癌发病风险降低(OR=0.77,95%CI=0.61-0.98)。3.随机森林模型分析结果显示,在两个比较组中rs7000921和rs7822495的Gini系数均显著高于其他遗传变异,提示这两个遗传变异可能与HBV感染结局相关。4.结合单变异和随机森林模型的分析结果,将rs4268139、rs7000921和rs7822495三个遗传变异纳入后续的分析。通过遗传风险评分方法,分析三个遗传变异的累积效应对HBV感染结局的影响。结果显示,高风险等级(4-6分)个体患乙肝相关肝癌的风险是低风险等级(0-3分)个体的1.37倍(95%CI=1.09-1.74,P=0.008)。5.遗传变异-环境交互作用分析结果显示,rs4268139、rs7000921和rs7822495与环境因素之间均不存在对HBV感染结局有影响的交互作用。遗传风险评分等级与环境因素之间的交互作用分析结果显示,遗传风险评分等级与吸烟之间存在对乙肝相关肝癌有影响的相加交互作用(Padd=0.041);遗传风险评分等级与饮酒之间存在对乙肝相关肝癌有影响的相乘交互作用和相加交互作用(Pmult=0.014,Padd=0.002)。结论:1.吸烟、饮酒和恶性肿瘤家族史是乙肝相关肝癌的独立危险因素。2.INTS10基因rs4268139的突变型等位基因G(与等位基因C相比)可增加慢性乙肝病毒感染的风险;INTS10基因rs7000921的TC基因型(与TT基因型相比)可降低乙肝相关肝癌的发病风险。3.INTS10基因遗传变异(rs4268139、rs7000921和rs7822495)之间的累积效应可促进乙肝相关肝癌的发生。4.INTS10基因遗传变异(rs4268139、rs7000921和rs7822495)的累积效应分别与吸烟、饮酒之间存在交互作用,促进乙肝相关肝癌的发生。
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