先天性甲状腺功能低下症（Congenital hypothyroidism,CH）作为新生儿时期一种常见的内分泌疾病,如若治疗不及时伴随着甲状腺的功能低下极有可能影响儿童的智力发育。作为甲状腺素合成的重要基因,甲状腺过氧化物酶（thyroid peroxidase,TPO）基因突变被认为是导致CH发病的主要遗传因素之一。本研究以来自陕西和新疆两个地区的的219例CH患者为研究对象,利用高通量测序技术对患者的TPO基因的外显子及相邻内含子片段进行测序,结合生物信息学分析方法,筛查疑似的致病突变位点,以探明西北地区CH患者TPO基因的突变谱和分布特点,并通过体外实验对本研究新发现突变位点的生物学功能进行初步的研究。在219例患者中,有17例患者检出突变。在检出的19个突变位点中,无义突变1种、剪接缺陷突变1种,错义突变17种。本研究首次发现的突变共有7个,包括p.Ser309Pro、p.Ala443Val、p.Asn592Ser、p.Asn674Ser、p.Asn798Lys、p.Ser853Leu及IVS7-1G>A。大多数突变（n=17）仅在一例患者中检出,除了p.Pro883Ser与p.Ala846Trp,分别在两例患者中发现;且携带相同突变的患者表型不尽相同。17例TPO突变患者中绝大多数（15例）具有正常大小或肿大的甲状腺。大多数患者仅检出一个突变,只有两例患者携带2个及以上的突变,这两例患者均为重度CH（确诊时FT4小于5pmol/L）,甲状腺大小正常。文献报道的热点突变c.2268dup T突变仅在本研究一例患者中检出。本研究对新发现的6个突变（p.Ser309Pro,p.Ala443Val,p.Asn592Ser,p.Asn674Ser,p.Asn798Lys,p.Ser853Leu）进行了体外生物学功能研究,首先构建几个蛋白的过表达HEK-293T细胞系,通过实时定量PCR与Western blotting发现6种突变并不影响TPO基因的m RNA以及蛋白的表达水平;以愈创木酚为底物,利用分光光度计对6种突变型蛋白和野生型蛋白的酶活以及酶动力学常数进行检测分析,发现所有突变蛋白的酶活性均有不同程度的降低。其中以p.Ser309Pro与p.Asn674Ser最为显著,Vmax/Km只有野生型蛋白的24%和12%（p<0.05）。这与两种蛋白三维结构建模预测分析结果一致,这两种突变造成TPO蛋白结构变化显著,从而影响酶与底物的亲和性,降低酶的催化效率。总之,通过对西北地区CH患者TPO突变的筛查和鉴定,发现TPO突变的总体检出率较低（7.8%）,其中携带多个TPO突变的患者比例不到1%,说明TPO突变可能不是导致我国CH发生的关键致病基因,TPO基因型与患者临床表型不具有直接的相关性。对所发现突变的生物学功能的初步研究则为阐明CH的发病机制以及TPO蛋白结构-功能之间的关系提供一定的理论依据和数据支持。