【摘 要】
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该论文利用密度泛函方法(Density Functional Theory,DFT)对一系列核酸碱基与氨基酸侧链间的氢键作用体系进行了研究.其中包括体系的结构稳定性分析,能量分析,频率变化分析,
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该论文利用密度泛函方法(Density Functional Theory,DFT)对一系列核酸碱基与氨基酸侧链间的氢键作用体系进行了研究.其中包括体系的结构稳定性分析,能量分析,频率变化分析,键长变化分析,氢键作用位点成键能力分析,成键能力与体系能量关系的分析.通过理论计算给出了各个体系的稳定结构,利用量子化学方法,结合一定的数学方法拟合出氢键作用位点成键能力的数学表达式,利用氢键作用位点成键能力与所成氢键的键能之间的线形依赖关系,得出体系结合能和氢键作用位点成键能力之间的联系.这不仅仅为深入理解核酸碱基与氨基酸侧链间的氢键作用,也为我们探索核酸和蛋白质之间复杂微妙的相互作用提供了理论基础;为进一步的实验研究提供了有价值的理论依据.同时,结合分子对接和全新药物设计方法,同源模建了大分子靶标法尼醇X受体(Farnesoid X Receptor,FXR)的配体结合域(Ligand Binding Domain,LBD)的三维结构,首先经过药物筛选模型合理性和有效性验证后,确立为用来搜索现有化学小分子库的激动构型的FXR-LBD药物筛选模型,并在超级计算机上采用并行版本的Dock程序对现有化学小分子库进行了虚拟筛选,针对虚拟筛选的结果进行了初步的类药性分析.
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