沈阳地区宠物犬猫主要传染病流行特点及犬细小病毒的遗传进化分析

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiebf1985
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近年来,随着国民经济和城市化进程的迅速发展,宠物犬猫的饲养量不断增长,宠物的生活质量和健康情况也受到了更高的关注,但有关宠物流行病的相关研究却相对滞后。本研究通过调查沈阳地区宠物医院常见的传染病和寄生虫病的发病量,统计分析发现真菌病、细菌病、寄生虫病和病毒病的月平均发病量和月平均气温呈显著相关(P<0.001),并有两个月的时滞效应。并且利用这四种类型疾病2013至2017年的月平均发病量数据进行时间序列分析,建立了ARIMA模型。本研究中的流行病学统计分析表明,沈阳地区宠物医院接诊量最高的传染病为犬细小病毒病。犬细小病毒传播范围广、感染性强,对我国宠物犬、军犬警犬及野生动物和经济动物都造成严重的危害。本研究采用分子生物学方法从遗传进化方面对沈阳地区犬细小病毒进行了研究和探讨。9份沈阳地区犬细小病毒的唾液、血液和粪便样本收集于2017~2018年,通过提取的VP2基因和NS1基因进行PCR克隆测序,得到沈阳地区犬细小病毒的基因序列,分析其氨基酸位点突变情况,进行同源性比对及系统发育树构建。结果表明通过测序得到的五条序列全部为CPV-2c型;亲缘关系与亚型和地区有关,与北京地区、吉林地区分离到的毒株序列较近,而与意大利、日本国家的序列相对较远。VP2序列中有10个核苷酸突变(nt14、16、520、817、819、1016、1042、1109、1278及1490)导致9个氨基酸的突变(aa5、6、174、273、339、348、370、426、497)。测得的6条NS1序列与7条标准毒株序列进行比对,发现其中有27个核苷酸突变(nt67、178、196、206、210、336、433、555、616、726、905、969、1017、1059、1207、1267、1463、1488、1558、1625、1664、1715、1728、1736、1792、1891、1953)导致12个氨基酸的突变(aa23、60、66、69、145、206、302、403、423、460、520、555)。沈阳地区的犬细小病毒和其他地区相比,进化速率没有显著差异,共发现12个位点存在正选择。这些突变可能是导致病毒变异的原因,新发现的突变位点也为以后的研究提供了参考。
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