公司制度下的委托人与代理人相离,两者具有不同的战略目标和风险偏好,委托代理问题由此产生。通过股权激励,可以在一定程度上调和委托人与代理人的目标差异。随着自主创新能力得以重视,R&D投入引起了企业的高度关注,成功的R&D投入可以帮助企业快速获得竞争优势,提高企业的核心竞争力,但R&D投入具有较高风险,一旦研发失败,可能给企业带来较大损失,由此对管理层提出了更高的要求。采用R&D投入指标可以有效地衡量股权激励的实施效果。本文以我国沪深两市三大板块2010-2014年所有发布并实施股权激励方案的上市公司为研究对象,筛选出218个观测样本,分析了股权激励的现状、效果,并基于委托代理理论、激励理论、技术创新理论等相关理论的理论基础,通过构建多元回归模型,研究了股权激励与R&D投入之间的相关关系,研究发现:(1)整体上看,股权激励与R&D投入之间表现为较弱的倒U型二次效应;(2)不同板块的股权激励对R&D投入的影响具有较大的差别。主板公司股权激励效果不显著,中小板公司股权激励与R&D投入之间表现为倒U型二次效应,拐点为3.97%,创业板公司股权激励与R&D投入之间表现出显著的线性关系;(3)不同股权性质下股权激励对R&D投入的影响具有较大的差别。国有企业股权激励与R&D投入之间表现出倒U型二次效应,非国有企业股权激励与R&D投入之间表现出比较明显的线性关系;(4)无论在哪个板块或股权性质下,高科技行业的股权激励一直在10%水平下显著。最后,本文提出了改善我国股权激励制度、有效提高R&D投入的方法建议,希望能起到一定的参考作用。