软件的知识产权保护在短短的几十年间经历了一个从无到有、从弱到强的过程:从最初单纯使用商业秘密保护发展到现在商标权、著作权、专利权等所交织的知识产权法网,使计算机软件在不同层面上得到了强有力的保护。不可否认,知识产权法在鼓励软件技术创新、推动软件产业发展方面做出了一定的贡献,也很好地维护了软件开发者的利益。但是,软件知识产权保护的发展趋势却走向了强保护主义的道路,开放源代码软件就在这种垄断与自由、共享的矛盾交织中产生、发展并壮大起来,开放源代码运动给我们提供了许多启示。通过分析开放源代码软件与现有知识产权制度之间这种依存与颠覆的关系,本文试图让人们认识到开放源代码软件所构建的知识产权规则、商业模式以及开放源代码运动的理念为软件知识产权保护的完善提供了借鉴与反思,也为整个知识产权制度的发展与完善提供了更加开阔的思路。本文通过以下三个部分的写作来对开放源代码软件的知识产权保护制度进行研究:笔者首先对开放源代码软件的概念及历史发展、许可证制度进行简要的描述,以明确开放源代码软件与计算机软件之间的区别,并揭示开源软件对知识产权制度的创新所在。文章的主体分别从商标法、著作权法、专利法这三个法域论述了开放源代码软件的特殊知识产权保护模式,以突出强调开放源代码软件在知识产权保护模式上的特别之处,论述的同时结合对国内外著名案例的分析,以说明开源软件当下所处的知识产权困境。最后,文章落脚于对开放源代码软件的保护模式与现行知识产权制度之间的冲突与融合进行分析论述,并对知识产权制度的理念进行反思。我们除了在现行的商标制度、著作权制度、和专利制度中寻找保护开放源代码软件的措施之外,更应该深刻思考知识产权制度本身的弊端和改革的必要性。