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目的：生命早期的肠道菌群的定植对婴儿的健康发展起着重大作用。本研究采用聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳法(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis，PCR-DGGE)探讨不同分娩方式对新生儿早期肠道菌群结构的影响。 方法：以32例同期出生的正常足月儿为研究对象，按分娩方式分为自然分娩组和剖宫产组(n=16)，分别于生后第1天(>12h)、3天及5天采集粪便样本，抽提样本中细菌基因组总DNA，并对其16S rDNA V3可变区进行PCR扩增和DGGE测定，获得肠道菌群分子指纹图谱，进行多样性和相似性等特征分析。 结果：(1)生命早期肠道菌群定植具有个体特异性，并呈动态变化。(2)多样性分析显示：新生儿生后第1天肠道菌群定植较少；生后第3天两组间多样性无明显差异；第5天多样性指数H’在剖宫产组和自然分娩组分别为1.474±0.560、1.920±0.290，优势度指数D分别为0.699±0.172、0.821±0.056，两组比较均有统计学差异(P<0.05)，剖宫产组H’、D均低于自然分娩组。(3)成对相似性分析：生后第3天，成对相似性系数Cs在剖宫产组及自然分娩组内Cs分别为0.584(0.395-0.631)、0.214(0.091-0.364)；剖宫产组内Cs值<0.30的占该组总Cs值个数的21.4％，而自然分娩组内Cs<0.30的占该组76.0％，两组比较均有统计学差异(P<0.01)；第5天，两组Cs值及分布情况比较无明显差异。 结论：生命早期肠道菌群定植具有个体特异性，并呈动态变化。生后第3天剖宫产个体之间表现出更高的肠道菌群结构相似性，第5大剖宫产儿肠道菌群种类及数量均落后于自然分娩儿，分娩方式影响了生命早期正常肠道菌群结构的建立。PCR-DGGE法在新生儿肠道菌群结构多态性及演进变化方面提供了更详尽的资料。