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本文利用微卫星标记对中国4个山羊品种6个群体(阿尔巴斯、二郎山、乌珠穆沁、阿拉善、辽宁绒山羊和陕南白山羊)，共计240个个体的遗传多样性进行了分析和研究。计算了等位基因频率，并以其为基础获得了各群体的平均杂合度、平均多态信息含量和平均有效等位基因数，分别为0.367～0.467、0.533～0.639、2.571～4.915。分析了群体内和群体间的遗传变异，为进一步对山羊品种的保存和利用提供科学的依据。 从已发表的牛和绵羊微卫星位点中筛选出30个位点，在4个山羊品种6个群体中进行遗传多样性分析，共检测到259个等位基因。表明所选出的30个微卫星位点在6个山羊群体中多态性比较丰富。 利用GDA软件获得了Nei氏标准遗传距离和共祖距离，结果表明品种间的遗传距离变异不大，说明我国这6个群体山羊的亲缘关系较近。根据Nei氏标准遗传距离和共祖距离，分别进行了NJ和UPGMA聚类，表明聚类结果较可靠，绒山羊尤其是内蒙古绒山羊先聚在一起。