大额牛(mithan或gayal,Bos frontalis),在我国分布于西藏自治区门隅、珞渝地区和云南省独龙江流域。大额牛的起源和系统地位问题,数十年来成为笼罩在分类学、畜牧学、动物遗传资源学等领域上空的疑团。这个问题关系到这一物种资源的开发和利用,在理论上涉及牛亚科动物的进化史乃至动物分类学原则的补充发展。涉及大额牛起源问题的结构基因分子进化研究迄今罕有报道。本文拟就分布在线粒体DNA链上的细胞色素b(cytb)基因序列和核基因组乙醇脱氢酶基因(ADH)序列测定作物种间对位比较,为探讨大额牛群体现状及其在牛亚科动物中的分类地位提供部分客观依据。1.对得到的序列以及从GenBank上下载的序列使用DNAMAN、Mega3.1等软件进行序列的处理与比较分析,统计出核苷酸组成和遗传距离等基本数据,并在Mega3.1软件中采用NJ法、ME法和MP法分别构建分子系统进化树。2.对13个大额牛个体线粒体cyt b基因序列进行分析,结果显示cyt b基因序列表现出强烈的A、T偏向性(57.1%),第三位A或C的偏好更加明显(44.6%+37.6%)。碱基替代转换大于颠换。乙醇脱氢酶基因碱基使用偏好不明显,但在密码子使用上也存在偏好(第8外显子)。3.通过序列分析及系统发育树分析,大额牛群体存在三种类型:普通牛类型,瘤牛类型和印度野牛类型。大额牛归于牛属是合理的,但无论从细胞水平,分子水平或是蛋白质水平大额牛都明显不同于普通牛、瘤牛和印度野牛,大额牛应是Bos属中单独的一个种。4.大额牛和印度野牛形态相似,分布地域条件及生态习性相近,结合前人的研究成果,本文推测大额牛有可能与印度野牛有着同一母系起源。5.运用cytb基因的核苷酸序列进行系统学研究时,三种构树方法得到进化树的拓扑结构基本一致,说明该结果较可信。同时证明cytb在种属阶元的分类和进化关系研究中较ADH基因,是一个有效的分子标记。