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核酸疫苗是90年代兴起的新型疫苗，已在多种疾病的防治中显示出巨大的潜能。然而核酸疫苗是一个新生事物，目前还存在许多尚未解决的问题，如核酸疫苗的免疫效果在不同动物个体中差异较大，有些疫苗在小个体的动物中免疫保护效果较好，而在大个体动物中，效果较差。 本实验就针对这个问题，采用几种策略对DNA疫苗的免疫效果进行调节：(1)候选抗原基因的筛选 本研究中分别选择了寄生虫和细菌感染性疾病作为研究对象，一种是囊虫病，一种是结核病。在筛选囊虫病候选抗原基因的过程中，本研究比较了cC1和AgB核酸疫苗在仔猪中的免疫保护效果，结果表明cC1核酸疫苗诱发的保护率高于AgB核酸疫苗。然后，我们对cC1核酸疫苗的免疫保护机制进行了探讨，发现cC1核酸疫苗是通过使囊尾蚴细胞发生凋亡来产生保护作用的。在结核病候选抗原的筛选中，我们研究了ESAT6、MPT64、Ag85A、HSP65四种核酸疫苗在小鼠中诱导的免疫应答。(2)针对疾病保护性免疫的特点选用合适的佐剂 本研究选用了泛素(Ubiquitin,UbR)作为免疫调节剂，发现泛素分子能够增强四种结核核酸疫苗诱导的细胞免疫应答。(3)免疫接种组合形式的探索 本实验将ESAT6 DNA疫苗和大肠杆菌表达的ESAT6蛋白联合应用，采用DNA prime-protein boost的方案，来观察DNA疫苗免疫应答的变化，结果表明该种方案增强了ESAT6 DNA疫苗诱导的细胞免疫和体液免疫，但并没有改变DNA疫苗诱导的初始免疫类型。(4)探讨接头序列在构建表位DNA疫苗中的影响 本研究根据已报道的结核抗原的表位，选用了MPT64和38kDa抗原各自的一个CTL表位，构建表位DNA疫苗，进行了接头序列(AAY)对这两种表位疫苗呈递影响的研究。结果发现，AAY接头序列提高了MPT64抗原表位的呈递，而没有显著影响38kDa抗原表位的呈递。这提示接头序列对CTL表位的呈递是有影响的。