炎症型肠癌及炎癌转化模型中基因表达变化的初步研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Ling_Hun
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结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,严重危害人类生命健康。根据基因表达情况,结直肠癌可分为5种亚型。其中之一为炎症型肠癌。本研究利用生物信息学方法观察了相关炎症因子在人类炎症型肠癌的表达变化,并建立了结肠炎相关结肠癌的小鼠模型,获得了炎癌转化小鼠模型的基因表达数据,并初步验证了相关炎症因子在动物模型中的表达变化,与人类炎症型肠癌进行了对比。(第一部分)结直肠癌的分子分型是近来临床关注和研究的重点和热点。而炎癌转化研究也越来越多地被研究者所关注。大量研究提示并证实了炎症转化为肿瘤的过程的存在,但并非所有的肿瘤都由炎症转化而来。本研究仅关注炎症型肠癌的若干炎症因子基因表达变化。本部分研究使用TCGA数据库下载的人类结直肠癌患者及癌旁组织的基因组数据,使用生物信息学方法,将结直肠癌分为包括炎症型肠癌在内的5类,并分析了ILIA、IL1B、IL6、IL23A、NFKB2、TGFB1、 TGFB3、PTGS2几个基因在人类炎症型肠癌的变化情况。结果发现在TCGA数据库647例肠癌中,98例肠癌被分型为炎症型肠癌,在炎症型肠癌中,上述8个基因均呈高表达。(第二部分)TCGA数据库的样本来源受地域、人种等因素影响,而针对不同遗传背景、不同地区人群,临床研究所取得的结果不尽相同。本部分研究使用我院临床患者的样本,使用生物信息学方法,将67例患者中的10例聚类至炎症型肠癌,并分析了ILIA、IL1B、IL6、IL23A、NFKB2、TGFB1、TGFB3、PTGS2几个基因在人类炎症型肠癌的变化情况,结果发现,上述几个基因均呈高表达,且变化趋势与TCGA数据库的结果一致。(第三部分)动物模型在疾病的病理机制的研究中一直有着无可替代的作用。在炎症相关性肠癌的动物模型中,AOM/DSS模型成瘤率高,周期短,最为常用。第三部分研究建立的AOM/DSS小鼠模型,作为结直肠炎癌转化的动物模型,进行了AOM/DSS小鼠肿瘤的全基因组表达谱芯片实验。结果发现,小鼠经历了正常→不典型增生或腺瘤→肠癌的变化过程。经过3个周期的DSS处理后,小鼠均生长了肿瘤。取不同处理周期的小鼠进行对比,发现随着时间的推移,以及DSS处理周期的叠加,除Tgfb3基因外,小鼠的Il1a、Il1b、Il6、Il23a、Nfkb2、Tgfb1、 Ptgs2几个基因均为高表达,且高表达趋势大致持续升高,与人类肠癌的8个基因的表达趋势相同,而Tgfb3的表达下降。总结第一部分、第二部分及第三部分研究的结果,我们认为人类结直肠癌是一类具有异质性的疾病,根据基因表达可进行进一步分子分型;无论在TCGA数据库,或中国人肠癌中,炎症亚型占比例相近,均为15%左右;炎症型肠癌表现为IL1A、IL1B、IL6、IL23A、NFKB2、TGFB1、TGFB3、PTGS28个基因表达的升高;AOM/DSS小鼠模型的8个基因表达变化与人类炎症型肠癌相近,可作为炎-癌转化模型用于炎症型肠癌的研究。AOM/DSS模型是否可应用于其他类型的肠癌,尚需进一步研究。
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