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基因调控网络是由一组基因、蛋白质、RNA、小分子以及它们之间的相互作用所构成的一种生化系统。对基因调控网络的算法研究在理论和实践上有着重要的意义。
本文首先给出化学主方程，并介绍几种精确随机模拟算法和快速近似算法。其次，对刚性生化系统的混合模拟算法进行了介绍，并给出多尺度随机模拟算法，然后在其基础上发展了改进多尺度随机模拟算法。数值模拟结果证实了改进多尺度随机模拟算法的优点。最后介绍时滞生化系统的精确模拟算法，并提出一种模拟时滞生物化学反应系统的自适应τ-Leap算法(DAτ-Leap)。该算法能够较大地提高模拟速度。数值实验证实了DAτ-Leap算法的优点。