青海省草原革蜱携带新型的RNA病毒的调查

来源 :中国科学院大学(中国科学院武汉病毒研究所) | 被引量 : 1次 | 上传用户:yingxiong324
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蜱虫是吸附在动物表面的吸血寄生虫,是多种人畜共患病毒病原的重要载体。2015至2017年,我们在中国青海省青海湖周边的牲畜体表采集了3162只蜱虫。形态学观察和分子鉴定显示采集的蜱虫均为草原革蜱(Dermacentor nuttalli)。利用二代测序技术宏基因组分析,在这些蜱虫样本中发现了4种新的RNA病毒,包括一种属于布尼亚病毒目白纤病毒科白蛉病毒属中一个未分类族群的新病毒(青海蜱病毒QHTPV)和3种未分类的新RNA病毒。此外,还鉴定出了一些来源于6个不同病毒科的短片段核酸序列。随后我们进一步调查了这些病毒在蜱虫中的流行病学情况。此前文献表明,属于白蛉病毒属同一族群且与青海蜱病毒相近的其他白蛉病毒都只检测到基因组中的S和L片段,缺失M片段,因此推断这一族群的布尼亚病毒可能只含有两个基因组片段。根据我们高通量测序以及生物信息学分析的方法,我们在青海蜱虫样本中找到了青海蜱病毒可能的基因组M片段。通过系统发育分析、与相关白蛉病毒的基因组组成和蛋白质翻译后修饰的比较分析,以及青海蜱病毒S、M、L片段在蜱虫分组核酸中检测出现率的相关性分析,进一步证明了该片段的特性以及作为青海蜱病毒M片段的可能性。我们的研究首次调查了青海省草原革蜱的病毒谱,揭示了蜱传病毒的遗传多样性,加深了对蜱传病毒的了解。同时证明了新发现的一株白蛉病毒基因组具有完整的S,M,L三片段,提示白蛉病毒可能由于序列相似度极低,其基因组M片段难以被发现;我们发现的新的白蛉病毒的M片段序列将可能促进未来发现其他新的白蛉病毒的M片段序列。
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