在环境污染问题依然严峻,环境侵权事件频繁发生的形势下,环境行政公益诉讼日益成为监督和解决环境污染防治问题的重要途径。虽然我国在试点地区推行环境行政公益诉讼并且修改民事诉讼法和行政诉讼法,在全国展开公益诉讼,但是在一些细节上仍有不少问题要解决。对此,惟有透过近年各级检察院、法院办理的环境行政公益诉讼案件数和质的实证分析,快速回应在检察机关法律地位、诉讼主体、举证责任、诉前程序、取证调查权、行政行为合法性审查等具体法律装置上的模糊混乱,才能及时发现和锻造中国特色环境行政公益诉讼的制度路向。基于此,本文选取全国范围和云南省环境行政公益诉讼开展情况作为切入点,通过统计分析的方式对我国环境行政公益诉讼案件办理情况、存在问题、产生原因和我国对于该问题对策进行研究,并探究人民检察院在履行法律监督职能与以原告身份提起行政公益诉讼的宪法定位下开展环境行政公益诉讼中存在的问题并开展对策分析。本文共分为四大部分。第一部分对环境行政公益诉讼的相关理论和概念等做出了简要的阐述,开展环境行政公益诉讼的现实必要性,以期对后文的分析论证提供理论支撑;第二部分分析了我国环境行政公益诉讼发展现状,通过对我国环境行政公益诉讼立法、司法解释、办案指南、全国案件开展情况和云南省环境行政公益诉讼开展情况进行概述和统计,进而得出本文的论证要点;第三部分选取最高检的指导案例“清流县环保局行政公益诉讼案”以及“陕西省宝鸡市环境保护局凤翔分局不全面履职案”进行分析,从而得出我国环境行政公益诉讼中存在诉前程序与诉讼程序的衔接问题、不履行法定职责的认定问题、检察机关的调查收集证据问题这三方面的主要问题;第四部分针对上一部分所述的环境行政公益诉讼中存在的问题对完善对策进行构想,通过理顺检察监督与环境行政权之间的关系和环境行政公益诉讼与相关诉讼之间的关系为基本思路,分别从充分发挥诉前程序作为前置程序的功能、以行政机关全面履职开展实质合法性审查、细化检察机关在行政公益诉讼中的取证权三个方面提出了相应的措施与建议。