目前,长江流域水污染治理实行的是传统行政区划分割和多部门共同监管的水污染防治体制,该体制打破了流域生态系统的整体性,呈现出九龙治水、各自为政的碎片化保护现象。科层制运行的水环境管理体制在面临跨界流域水污染问题时会面临困境,不同区域政府间、部门间基于利益博弈很难形成协调合作,对于跨界水污染纠纷也很难公平进行责任认定。对于长江流域而言,水污染治理困境的根源在于现有流域管理体制下府际环境治理的不合作,正是因为不合作,才导致公地悲剧现象的发生。本文共有五大部分。第一部分是绪论,主要阐述写作的背景、研究意义、研究方法和创新点;第二部分,介绍流域水污染治理的核心概念和理论基础,其中整体性治理理论、集体行动理论和府际管理理论能为分析长江流域治理问题产生的原因、提出相关建议提供思路;第三部分,基于当前长江水污染的严峻状况,指出现阶段政府在长江流域水污染治理中面临的问题;第四部分,从五个方面分析长江流域水污染治理现状产生的原因,分别是传统重发展轻环保的理念尚未改变、水环境保护法律体系不健全、流域水环境管理体制单一、区域政府间合作机制不完善和外部监督机制不健全;第五部分,在前文分析的基础上,对完善长江流域水污染府际治理法律制度提供相关建议。总而言之,本文以长江流域水污染治理现状作为切入点来研究,对长江流域水污染治理现状产生的原因进行剖析,进而提出完善长江流域水污染府际治理法律制度的建议,即在政府主导的基础上,在纵向治理上实现流域立法创新、流域管理体制创新,横向治理上完善相关合作制度,同时加强公众和司法监督、引入社会资金投入,形成多元主体参与的长江流域水污染治理法律制度体系,由此改变因缺乏法律的规范和引领,而造成的区域政府间很难形成制度化合作治理机制的局面,以期能够从根源上打破行政壁垒、提高政府治理效率,从而遏制住长江流域水污染恶化,推动长江经济带生态文明建设的协同发展。