MicroRNA结合位点基因多态性与非小细胞肺癌预后的关联研究

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wtuye262626
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肺癌是人类最常见的恶性肿瘤之一。近二十年来,持续增长的烟草消费和环境污染使我国肺癌发病率和死亡率一直呈上升趋势。肺癌已成为目前威胁我国居民生命和健康的重要疾病之一,亦是亟待解决的重大公共卫生问题。在肺癌患者中,约85%的病例是非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC),因此对其进行研究具有重要的临床价值。手术是治疗早期非小细胞肺癌治疗的主要手段,但术后复发率较高。然而大部分患者在就诊时已是中晚期,只能接受以化疗为主的全身治疗。TNM分期和病理组织学类型是目前判断NSCLC预后的主要依据。但是,往往具有同样临床特征的NSCLC患者,即便采用同样的治疗手段,其病情进展和生存时间却常常可有很大的差异。越来越多的研究表明,个体遗传因素在这种预后差异中扮演了重要的角色。因此,寻找包括单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)在内的一些遗传分子标志物用于提高临床预后的预测价值,是目前国内外肿瘤学研究领域的热点。单核苷酸多态性是最常见的遗传学改变。大量研究表明,SNP可以通过影响基因的表达、结构和功能,进而影响肿瘤的发生发展。因此,本研究选择具有潜在功能性的位于microRNA(miRNA)与靶基因结合位点的SNP,探讨这类SNP与非小细胞肺癌预后的关联。第一部分MiRNA-200b/c结合位点基因多态性与晚期非小细胞肺癌预后的关联研究MiR-200家族在许多肿瘤中发挥肿瘤抑制功能,miR-200b和miR-200c是目前研究得最广泛和深入的。单核苷酸多态性可以通过产生新的miRNA结合位点,或破坏已有的结合位点,来影响miRNA与靶基因的亲和力。[目的]探讨同时位于miR-200b和miR-200c与靶基因结合位点的SNP与晚期NSCLC患者预后的关联。[方法]我们的研究仅限于Ⅲ期或Ⅳ期未手术、接受铂类为一线化疗的非小细胞肺癌患者。第一阶段(1期)纳入303例患者,招募于南京医科大学第一附属医院和附属肿瘤医院。第二阶段(2期)纳入340例患者,招募于上海胸科医院和南京胸科医院。所有患者均为组织病理学或细胞学确诊的NSCLC,并至少由两名病理医师确诊。通过在线预测软件,我们共得到10个可能影响miR-200b/c与靶基因结合的SNP位点。1期和2期样本基因分型均采用Sequenom MassARRAY iPLEX平台。我们采用荧光素酶报告基因对阳性位点进行功能研究。[结果]10个位点在1期303例标本中均进行了基因型的分析,所有SNP均符合 Hardy-Weinberg 平衡(HWE)。只有一个 SNP 位点 rs17224177 与 NSCLC生存显著相关,我们将这个位点在2期340例样本中进行了验证。我们发现rs17224177在两阶段实验中均与NSCLC总生存期相关,尤其在合并样本中(相加模型:校正HR=1.70,95%CI:1.24-2.34)。生物信息学分析rs17224177的突变型等位基因G可能会破坏miR-200b/c与靶基因GLT8D3的结合。我们构建了含GLT8D3 3’UTR的荧光素酶报告基因质粒(分别含有rs17224177 A和G等位基因)。结果显示转染含有rs17224177 G等位基因的荧光素酶表达水平较转染A等位基因的荧光素酶表达明显增高(A549细胞株,报告基因质粒分别与miR-200b,miR-200c 同时转染,P值分别为P<0.0001,P=0.0053)。[结论]GLT8D3 rs17224177 A>G会破坏基因与miR-200b/c的亲和力,并增加晚期NSCLC患者的死亡风险。第二部分MiR-502与SET8结合位点多态性与非小细胞肺癌患者预后的关联研究基因多态性可以通过产生新的miRNA结合位点,或破坏已有的结合位点,来影响miRNA与靶基因的结合。SET8蛋白是一个含有SET结构域的甲基转移酶,在多种生物学过程中发挥重要作用。[目的]探讨一个位于SET8 3’UTR与miR-502结合位点的功能性SNP,rs16917496 T>C,与NSCLC患者预后的关联。[方法]本研究的所有病例均来自南京医科大学第一附属医院。采用Taqman基因分型技术,我们在576例NSCLC血液标本中对rs16917496进行基因分型。之后,我们用荧光素酶报告基因对该位点进行功能研究,并用与血液标本匹配的病理切片进行免疫组化染色来进一步验证。[结果]Log-rank检验和Cox回归模型均提示rs16917496 CC基因型与较长的总生存期和较低的死亡风险显著相关(Log-rank P=0.031;共显性模型:粗HR=0.44,95%CI:0.26-0.74)。逐步 Cox 回归分析显示 rs16917496 是 NSCLC 患者预后的独立预测因子。并且该位点与NSCLC预后的关联在不吸烟患者、接受化疗的患者和没有糖尿病的患者中更为显著。交互作用分析显示rs16917496与吸烟状况存在显著的相乘模型的交互作用,校正后P值为<0.001。荧光素酶报告基因显示,rs16917496的突变型C等位基因可以通过增强miR-502与SET8的结合能力,来下调SET8的表达。同时,对192例病例切片进行免疫组化染色显示,CC基因型与SET8蛋白低表达相关(P=0.007)。SET8低表达的患者总生存期较长。[结论]我们的研究表明,SET8 3’UTR rs16917496 T>C可以预测非小细胞肺癌患者的预后。Rs16917496通过影响miR-502与SET8的结合来调节SET8的表达,进而影响非小细胞肺癌患者的预后。
其他文献
第一章晚期强直性脊柱炎韧带骨化程度与脊柱骨盆及临床参数的相关性研究目的:该研究目的是评估晚期强直性脊柱炎患者韧带骨化程度与脊柱骨盆及临床参数的相关性。方法:回顾性分析2017年3月至2018年7月我科收治的41例接受经椎弓根椎体截骨术(pedicle subtraction osteotomy,PSO)的患者,采用新型的CT韧带骨化评分(CT syndesmophyte score,CTSS)来评
背景和目的肺癌是世界范围内常见的恶性肿瘤,其发病率和死亡率居高不下,其中非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)占全部肺癌的80%以上。表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是NSCLC最重要的驱动基因之一,EGFR信号通路与肿瘤的生长、侵袭和转移密切相关。表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-t
背景:已有研究认为促卵泡激素(Follicle stimulating hormone,FSH),独立于雌激素,通过其受体直接作用于破骨细胞,参与骨质疏松的发病机制。而目前按照FSH水平分层进行蛋白组学研究的报道甚少。目的:对比不同FSH水平下,绝经后骨质疏松模型大鼠的骨质疏松情况。对比不同FSH水平下,卵巢切除术后大鼠的血清蛋白表达差异,筛选出差异表达蛋白,筛选出新的绝经后骨质疏松的血清标志物。
戏剧的教育价值综合性很高。在幼儿园中开展戏剧教育课程,既有助于促进幼儿身体和语言表达能力的发展,又能让幼儿在亲身实践中获得情感体验,并且有效促进幼儿发展音乐、美术、舞蹈等多方面的艺术特长。但是我国现行幼儿戏剧教育缺乏系统性、创新性及教育性,仅仅是以表演的方式出现。文章在《幼儿园教育指导纲要(试行)》指导下,探索如何在新时代更有效地开展戏剧教育,希望为幼儿工作者提供经验和帮助。幼儿园戏剧教育的
期刊
胰岛β细胞功能缺陷是2型糖尿病发生发展的核心环节。本实验室前期发现,转录因子Ets-1在β细胞功能缺陷中起到重要作用,表现为:糖尿病模型鼠和β细胞特异性Ets-1转基因小鼠随着Ets-1表达的升高,出现胰岛素分泌功能障碍、空腹血糖升高以及糖耐量受损;体内外过表达Ets-1均造成β细胞功能缺陷,在原代胰岛和β细胞系中干扰Ets-1可避免长期高糖造成的β细胞功能障碍。然而,降低Ets-1表达通过何种具
急性肾损伤(Acute kidney injury,AKI)是一组以肾脏功能在短期内急速下降为标志的常见临床综合征,其病因复杂,常见的致病因素有肾毒性药物(如顺铂,cisplatin,CP)、缺血缺氧损伤、重症感染等,具有高发病率和高死亡率等特点。肾小管上皮细胞(Renal tubular epithelial cells,RTEC)损伤是AKI的主要病理基础,损伤后的细胞正常结构遭到破坏,骨架排
菌斑性牙龈炎(Plaque-induced gingivitis)是一种以牙龈红肿胀痛,刷牙出血及口臭为主要症状的慢性感染性疾病。牙齿颈部及龈沟内堆积的菌斑微生物及其产物作用于牙龈从而导致炎症反应。菌斑性牙龈炎如不彻底治疗可能发展为牙周炎,最终可能导致牙齿松动脱落,咀嚼功能丧失,极大地危害口腔和全身健康。菌斑性牙龈炎患者常感知到牙龈部位的胀痛不适感与炎症因子以及微生物毒性产物的刺激下发生的组织反应
B细胞淋巴瘤滤过性病毒插入位点1(B cell-specific MLV integration site-1,Bmi1)基因属于Polycomb基因家族成员,与多种干细胞的自我更新相关,其缺失将会引起小鼠生长阻滞及成熟前衰老。然而,Bmi1缺失是否会影响精子发生尚不清楚。本研究主要利用Bmi1敲除小鼠,观察Bmi1缺失对精子发生的影响,此外,就Bmi1缺失引起精子发生障碍的相关分子机制进行深入研
第一部分生物活性玻璃45S性能的基础研究目的:通过表征并分析生物活性玻璃45S的表面形貌、尺寸分布和体外矿化等理化性能,为本课题进一步评估和优化新型球状纳米生物活性玻璃相关性能提供实验基础。方法:利用X射线光电子能谱分析仪(X-ray photoelectron spectroscopy,XPS)检测生物活性玻璃45S的元素种类及相对含量。利用扫描电子显微镜(Scanning electron m
经过三年一届的期待,三个月的筹备和三个星期的赛程,由福建省教育厅、福建省总工会主办、福建教育学院承办的福建省第五届中小学教师教学大赛在2021年12月6日随着11名各学段特等奖选手的产生而圆满落幕。本届大赛共有福州市、厦门市、平潭综合实验区、省直学校等11个参赛代表队528名选手参赛。大赛设置了高中组、初中组、小学组和幼儿园组4个比赛组别,
期刊