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目的:IncC型质粒是耐药基因传播的重要载体,给临床疾病的治疗带来严峻挑战。本研究深入分析了肠杆菌科菌株中的IncC型耐药质粒的基因组学与生物信息学特征,主要目的是探究IncC型质粒在进化过程中的规律性与多样性,以及耐药菌株的耐药机制,为疾病的治疗提供分子依据。方法:选定临床分离的11株肠杆菌科的多药耐药菌,通过16S r DNA及标示基因进行菌种的初步判定。结合改良Carba NP法、药物敏感性试验以及PCR扩增筛查鉴定耐药基因结果,确定耐药菌株表型。用Ultra Clean?Microbial DNA Isolation kit试剂盒提取菌株的基因组DNA,对其进行Mi Seq或Pac Bio RSII测序,得到相应的染色体和质粒全序。将测序结果与参考质粒pR148和pR55进行基因组和生物信息学比较分析,并对部分菌株进行接合转移实验以验证其接合转移能力。结果:根据标志基因orf1832/orf1847,rhs1/rhs2,i1和i2的存在与否,将本研究的13个IncC型质粒分为1型、2型和1/2杂合型。用质粒骨架区去重组的SNPs构建ML进化树。进化树包含3个分支,分别对应1型、1/2杂合型和2型IncC型质粒,与标志基因的分类结果一致。同时,本研究发现,IncC型质粒在进化过程中能获得不同的移动元件及各自独特的耐药基因,这些耐药区域包括ARI-A、ARI-B、含有blaCMY的移动元件以及其他耐药移动元件,如MDR区等。外源插入区的插入常常会导致质粒骨架区的缺失、倒位和易位。p QD1501-Ct1、p205880-Ct1/2和p A2293-Ct2分别包含3种亚型质粒完整的接合转移区,作为代表质粒均能通过接合转移实验水平转移到大肠杆菌中。本研究中p T5282-Ct2是首次发现的含有blaIMP-8的IncC型质粒,而且,本研究还发现Tn6395、In2-76和ISEcl10等新型移动元件以及6个新命名的移动元件。结论:除标志基因外,IncC质粒骨架区去重组的核心SNPs构建的系统发育树可以辅助质粒分型,且每个亚型的代表质粒均能在自然状态下通过接合转移实现跨菌种传播,这将是细菌耐药广泛传播与流行的机制之一。本研究首次报道携带blaIMP-8的IncC型质粒,并发现3个新型移动元件和6个新命名的移动元件。本课题研究为IncC型质粒分型提供了新的技术方法,同时,为耐药菌的防治提供了理论指导与分子依据。