MMP-12、MMP-13基因多态性与结直肠癌发病风险的关联研究

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目的: MMP-12、MMP-13基因启动子区存在单核苷酸多态(singlenucleotide polymorphism,SNP)变异,这些SNPs位点与机体对结直肠癌的易感性相关联。本研究探讨MMP-12、MMP-13基因rs2276109A/G和rs2252070A/G单核苷酸多态性与结直肠癌遗传易感性的相关性,为结直肠癌高危人群的筛检及诊治提供有利的分子生物学依据。方法:选取2012年2月-2013年2月间就诊于河北医科大学附属第四医院的129例结直肠癌患者和74例健康人群做病例-对照研究。采用蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取白细胞中DNA,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)方法对MMP-12、 MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两SNP位点等位基因基因型频率分布进行检测。实验数据使用SPSS13.0版软件包(SPSS Company,Chicago,Illionis,USA)进行统计学分析。对直肠癌组、结肠癌组和对照组年龄之间差异进行t检验;并分别对两组的性别差异、等位基因分布频率及基因型分布频率进行χ2检验。并利用Hardy-Weinberg对两个组别基因型频率的分布进行连锁平衡分析。使用logistic回归方法计算相对风险度的比值比(oddsratio, OR)及其95%可信区间(confidence interval, CI)。采用EH软件和2LD软件对MMP-12MMP-13基因rs2276109A/G和rs2252070A/G两位SNPs行联合分析,P <0.05作为差异有显著性的标准。结果:1实验对照组中MMP-12rs2276109A/G MMP-13rs2252070A/G两位点基因型分布频率均遵从Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。2MMP-12基因rs2276109A/G多态性与CRC相关性分析:MMP-12基因rs2276109A/G位点上A和G等位基因频率在病例组中分别为98.7%和1.4%,在实验组结肠癌患者中分别为99.0%和1.0%,两组相比在统计学上无意义(P>0.05),在实验组结肠癌患者中,A/A、A/G、G/G基因型出现的频率分别为98%、2.0%和0%,在对照组中三种基因型出现的频率分别为97.3%、2.7%和0%,两组相比无统计学意义(P>0.05),与A/A基因型个体相比较,携带A/G基因型个体与结肠癌的发病风险无相关性(OR=0.345,95%CI=0.019-6.145);而在实验组直肠癌患者中,A和G等位基因出现的频率为93.6%、6.4%,与对照组相比在统计学具有显著性差异(P=0.049),说明MMP-12rs2276109A/G上等位基因出现G的频率升高会增加直肠癌的发病风险,在实验组直肠癌患者中A/A、A/G、G/G三种基因型出现的频率为87.2%、12.8%、0%,与对照组相比在统计学上具有显著性差异(P=0.044),与A/A基因型个体相比较,携带A/G基因型个体能增加直肠癌的发病风险(OR=10.193,95%CI=1.552-66.939)。3MMP-13基因rs2252070A/G多态性与CRC相关性分析:MMP-13基因rs2252070A/G位点上A和G等位基因频率在实验组结肠癌中分别为47.1%和52.9%,在对照组中分别为32.4%和67.6%,两组相比较具有显著性差异(P=0.019),说明MMP-13rs2252070A/G上等位基因A的频率升高会增加结肠癌的发病风险,在实验组结肠癌患者中,A/A、A/G、G/G基因型出现的频率分别为15.7%、62.7%和21.6%,在对照组中三种基因型出现的频率分别为13.5%、37.8%和48.6%,两者相比具有统计学意义(P=0.007),与G/G基因型个体相比较,携带A/G基因型个体能增加结肠癌的发病风险(OR=6.787,95%CI=2.392-19.253),携带A/A基因型个体对结肠癌的发病风险无影响(OR=3.378,95%CI=0.912-12.514);而在实验组直肠癌患者中,A和G等位基因出现的频率为42.3%、57.7%,与对照组相比在统计学上无意义(P>0.05),在实验组直肠癌患者A/A、A/G、G/G三种基因型出现的频率为21.8%、41.0%、37.2%,与对照组相比在统计学上无显著性差异(P>0.05),与G/G基因型个体相比较,携带A/G、A/A基因型个体对直肠癌的发病风险无影响(OR=1.475,95%CI=0.656-3.317,OR=2.404,95%CI=0.871-6.640)。4运用EH软件及2LD软件对MMP-12、MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两位点SNPs进行联合分析,结果认为:4.1在对照组与实验组结肠癌患者中, MMP-12、 MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两位点间存在较强的连锁不平衡现象(D’=0.992),出现频率最高的单体型是rs2276109A-2252070G,出现频率为66.2%,其次依次为rs2276109A-2252070A、rs2276109G-2252070G和rs2276109G-2252070A,出现的频率依次32.4%、1.4%、0%。人群中rs2276109A-2252070A单体型可以增加结肠癌发病风险(OR=1.783,95%CI=1.060-2.997),rs2276109A-2252070G、rs2276109G-2252070G单体型则可减少结肠癌发病风险(OR=0.573,95%CI=0.342-0.961、OR=0.023,95%CI=0.001-0.454),而rs2276109G-2252070A单体型由于样本数量少,单体型漏检。4.2在对照组与实验组直肠癌患者中, MMP-12、 MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/G两位点间存在较弱的连锁不平衡现象(D’<0.001)。人群中rs2276109A-2252070G单体型可减少直肠癌发病风险(OR=0.615,95%CI=0.387-0.978),而rs2276109G-2252070A单体型可能由于样本数量少,单体型漏检,其他两种单体型OR值分别为0.1.329(95%CI=0.829-2.128)、2.290(95%CI=0.432-12.138),此两种单体型可能与该病发病风险无关。结论:1MMP-12基因rs2276109A/G SNP可能与结肠癌的发病风险无关;但与直肠癌的发病风险有关,与A/A基因型个体相比较,携带A/G基因型个体能增加直肠癌的发病风险。2MMP-13基因rs2252070A/G SNP与结肠癌的发病风险相关,与G/G基因型个体相比较,携带A/G基因型个体能增加结肠癌的发病风险,携带A/A基因型个体与结肠癌的发病风险无相关性;但该基因位点SNP可能与直肠癌的发病风险无关。3MMP-12、MMP-13基因的rs2276109A/G和rs2252070A/GSNPs位点间在结肠癌存在较强连锁不平衡(D’=0.992);在直肠癌中存在较弱的连锁不平衡(D’<0.001)。
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