基于转录组学探究Laceyella sacchari FBKL4.010产四甲基吡嗪的研究

来源 :贵州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangfei223752
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Laceyella sacchari FBKL4.010归属于高温放线菌科(Thermoactinomycetacea e)、莱斯氏菌属(Laceyella sp.)下的糖莱斯氏菌(Laceyella sacchari),前期研究表明,其在固态发酵条件下具有产四甲基吡嗪的能力,但并未对其发酵特性进行研究,此外Laceyella sacchari FBKL4.010产四甲基吡嗪的分子机制也并不明晰。本课题首先研究固态和液态发酵条件下Laceyella sacchari FBKL4.010的发酵特性,之后通过转录组测序技术揭示了液态发酵条件下Laceyella sacchari FBKL4.010产四甲基吡嗪过程中相关基因的表达情况,并筛选出与四甲基吡嗪合成相关的候选基因,最后探究外源添加物对Laceyella sacchari FBKL4.010的代谢调控作用。主要研究成果如下:1.固态发酵过程中,基质外观随着发酵时间的延长而逐渐呈现褐色,气味也逐渐浓郁。水分含量变化呈逐渐下降趋势,酸度呈逐渐上升趋势,而氨基酸态氮含量、中性蛋白酶、酸性蛋白酶、纤维素酶、脂肪酶、糖化力和液化力的变化均呈先上升后下降的趋势。固态发酵条件下共检出51种挥发性成分,主成分分析显示各发酵阶段挥发性成分的种类和含量差异较大,在发酵前中期,挥发性成分主要为酮类和醇类,而发酵后期以醛类、酸类和吡嗪类为主。2.扫描电镜结果显示菌株在液态发酵基质中生长状态良好,菌丝体无明显附着物、孢子和孢子丝结构立体,菌丝体平均直径为0.42±0.11μm,展现了菌株生长良好的形态结构。理化指标结果显示菌体在液态发酵培养基中能进行生长代谢,并且具备产四甲基吡嗪的能力。液态发酵过程中共检出27种挥发性成分,主要有酮类、醛类、醇类、酸类、酯类、吡嗪类和烷烃类。发酵前中期主以醇类、酯类和烷烃类为主,在发酵中后期主要是酮类、醛类、酸类和吡嗪类物质。3.对液态发酵条件下的Laceyella sacchari FBKL4.010进行转录组测序,并对测定结果进行差异表达分析。共筛选到差异表达基因1284个,其中显著上调差异基因808个,显著下调差异基因476个。GO功能富集分析显示,差异基因主要富集在生物过程中的细胞过程(GO:0009987)、代谢过程(GO:0008152)和单生物过程(GO:0044699);细胞组分中,主要富集在细胞(GO:0005623)、细胞部分(GO:0044464)和细胞膜(GO:0016020);分子功能中,主要富集在催化活性(GO:0003824)、结合(GO:0005488)和转运活性(GO:0005215)。KEGG代谢途径富集分析显示,差异基因主要富集在氨基酸代谢、能量代谢和碳代谢等途径。4.结合结合相关文献,从差异表达基因中初步筛选与四甲基吡嗪合成相关的基因,其中10个显著上调差异基因和20个显著下调差异基因。主要涉及氨基酸代谢、碳代谢、柠檬酸循环、嘌呤代谢、嘧啶代谢、丁酸代谢和丙酮酸代谢等途径。从筛选出的30个差异表达的候选基因中,随机选取7个基因(roc F、roc G、pck A、lsp A、ack A、ilv B、ilv N)进行荧光定量PCR验证,结果表明各基因的表达趋势与转录组测序的结果基本一致,但差异倍数存在些许差异,这可能与菌株活力、RNA降解、仪器灵敏度等不同有关。5.代谢调控实验表明,外源添加乙酸钠不利于Laceyella sacchari FBKL4.010生物量的积累,此外,适宜浓度的乙酸钠对体系中乙酸生成有一定的负面影响。荧光定量PCR测定结果表明,不同浓度的乙酸钠会影响Laceyella sacchari FBKL4.010乙酸激酶基因ack A的表达量,Pearson相关性分析进一步验证了上述实验结果。摇瓶发酵实验结果表明,外源添加物乙酸钠(3.6 g/L)对体系中乙偶姻的积累有显著影响(p<0.05),但对四甲基吡嗪含量的影响较小(p>0.05)。
其他文献
随着我国城镇化率的不断提高,污水处理的规模越来越大,产生的污泥难以处置,引起诸多环境污染问题。将污泥进行好氧堆肥处理后土地利用在相对欠发达地区具有较好的应用前景。本研究以兴义某生活污水处理厂的剩余污泥为堆肥原料,以锯末、树皮、谷糠为调理剂,经好氧堆肥处理后制成满足国家标准的污泥堆肥产品。将污泥堆肥产品作为基肥按不同比例(后文及正文中统称为W0处理、W1处理、W2处理、W3处理、W4处理)与农田土壤
学位
为适应超导电缆商业化运行需求,提出一种考虑不同应用模式下制冷系统和过热保护影响的含超导电缆的配电网可靠性评估方法。依据超导电缆制冷系统的工作原理、故障特性及过热保护装置的动作逻辑和自动重合规则,对超导电缆系统可靠性进行建模分析。考虑了低压联络和配电线路增效两种典型应用模式下超导电缆接入对配电网的可靠性影响,采用融入了计及超导电缆的新增故障模式的最小割集法求解配电系统可靠性指标,实现含超导电缆的配电
期刊
白酒酿酒废水是一种低pH值、高色度、高氮磷、易降解的高浓度有机废水。目前,大中型白酒企业已具备较完善的废水治理设施,但大多数中小型企业面临废水处理工艺复杂、处理成本高和出水难达标的问题。此外,部分城镇污水处理厂由于污水收集管网不完善、雨污分流不彻底等,导致污水厂碳源不足,为了实现较高的脱氮效率,通常需要外加碳源,这种方式存在资源浪费、运行成本高的问题。鉴于白酒酿酒废水中易降解有机物比例高、可生化性
学位
耕地土壤镉-砷(Cd-As)复合污染危害严重且治理复杂,有效修复Cd-As复合污染稻田是目前实现农田安全利用的难点。钙(Ca)、镁(Mg)是植物信号网络调节的重要离子,“土壤-作物”体系中Cd/As的迁移、吸收、转运均与Ca2+、Mg2+调控紧密相关,研究Ca、Mg对稻田土壤钝化效应与水稻Cd/As富集调控特征,对修复Cd-As复合污染稻田土壤,降低稻米Cd/As含量具有重要意义。本研究开展施加5
学位
锑(Sb)是一种不可再生的稀有金属,近年来,由于人为活动和不断加大的Sb资源开采,导致土壤中的Sb含量不断增加,严重危害生态系统以及人类健康。因此寻求Sb污染土壤高效合理的治理方法刻不容缓。腐殖质被认为是环境友好型添加剂,有着能够改良土壤、促进植物生长、影响土壤重金属迁移转化以及生物可利用性、不易造成二次污染等优点,然而在Sb污染土壤中,腐殖质对于土壤与植物的作用机制还不够明确。因此,明确腐殖质对
学位
我国农村地区生活污水排放总量正在逐年增加,但由于农村建设资金有限、农村生活污水分散、污水量小难以大规模铺设管网。一体化设备因有占地面积小、出水稳定、操作简单的优点而被广泛应用。相比传统AAO工艺,本研究在AAO工艺前端增设预缺氧池,增加好氧池到预缺氧池回流,并向各主要池体加入填料来增强系统的脱氮除磷效率。同时研究改良AAO一体化设备在不同控制条件下对污染物去除效率的影响,并提出优化的运行参数,研究
学位
含铁矿物普遍存在于各种自然系统和工业设施中,这些矿物很有可能含有有毒金属,例如,毒砂在其晶体结构中同时含有铁和砷,而铁氢化物由于其巨大的表面积可吸附重金属。作为一种普遍存在的有毒类金属砷,其主要以砷酸盐和亚砷酸的形态广泛存在于自然水域土壤中。目前国内外研究以提出厌氧条件下铁矿物的演化是控制沉积物和地下水中矿物组成和类金属As迁移的重要过程之一,且微生物还原在自然环境中的铁矿物转化中起着关键作用。查
学位
近年来,我国土壤重金属污染问题较为突出,重金属可在农业种植系统中积累和迁移,并通过农产品进入食物链,由此带来的农产品安全风险和人体健康风险不容忽视。化学钝化技术因具有投入低、见效快、适宜大面积污染土壤修复以及能实现边修复边生产等优点已被广泛应用于重金属污染土壤修复。然而,施加钝化剂仅是通过改变重金属赋存形态及生物有效性将重金属固定在土壤中,随着钝化时间的推移及环境条件的改变,钝化剂所固定的重金属具
学位
宫颈癌的治疗手段通常是以手术为主,结合综合性治疗方法,术后并发症之一是下肢淋巴水肿。本文通过阐述宫颈癌术后下肢淋巴水肿的现状,归纳了术后发生下肢淋巴水肿的相关因素和预防护理措施,提出了宫颈癌术后下肢淋巴水肿的护理研究进展,以期为临床护理实践提供借鉴。
期刊
随着工业和社会快速发展,锑矿被过度开采,导致锑过度积累在矿区周围环境中,危害环境,甚至进入食物链危及人类健康。为去除矿区周围水环境中的锑和保证矿区锑污染土壤的安全利用,本研究基于水相吸附和室内土培两个实验体系,探究新型炭基材料—纳米零价铁污泥生物炭对锑矿区污染的修复效果。通过XPS分析吸附前后锑的价态变化,阐明纳米零价铁污泥生物炭(nZVI-BC)对水相中锑的去除机制。基于土壤性质和土壤中锑形态含
学位