有效开展政府绩效评估是现代公共管理的前沿课题，也是促进政府管理创新、推进行政体制改革的有效工具，它不仅有利于政府绩效的提高，也有利于政府职能的进一步转变。从本质上而言，政府绩效评估就是对政府职能履行情况以及所产生的效果进行考核，是针对政府或者某一政府部门的职能及其行使情况开展的。政府职能内容决定了政府绩效评估指标体系的具体内容，政府工作重心决定着评估指标体系的权重分布，政府的职能关系决定着绩效评估指标体系的结构设置。因此，构建科学合理的政府绩效评估指标体系必须以科学定位政府职能为前提。多年来，我国在深化行政体制改革上作了许多有益的理论研究和实践探索，大力推进政府职能转变，并取得了一定的成效，新形势、新环境以及新需求对政府职能提出了更新、更高的要求，政府职能的转变决定了政府绩效评估指标体系必须随之加以完善，也对构建科学合理的指标体系提出了一些新要求。随着这绩效评估的引入和发展，我国学术界众多专家学者和各级地方政府都对如何构建科学合理的政府绩效评估指标体系进行了许多思考和实践，并取得了一定成效，许多地方形成了绩效评估模式并构建了一些具有代表性的指标体系。然而，在构建我国政府绩效评估指标体系的理论探索和实践过程中还存在一些不足之处不容忽视。总体而言，就是我国政府绩效评估指标体系还存在着与政府职能相背离的问题。我们必须积极采取措施，准确定位政府职能，明确指标内容与权重，合理构建政府绩效评估指标体系，来科学指导政府绩效评估，正确引导政府行为。本文从研究政府职能和政府绩效评估体系的理论入手，深入分析了政府职能和政府绩效评估体系的关系，指出当前我国政府主要职能，从构建流程、构建原则和总体框架三个方面分析了我国政府绩效评估指标体系的职能体现。结合近年来我国政府绩效评估指标体系的实践模式，指出我国政府绩效评估指标体系存在的最突出问题就是与政府职能相背离。针对造成这一突出问题的原因，要采取措施，以准确定位政府职能为前提，公众满意度为导向，构建科学合理的政府绩效评估指标体系促进政府职能转变，提高政府绩效。