真核生物中，大部分蛋白呈现出由多个domain和motif构造而成的模块化构造方式(cassette-like fashion)。研究表明，蛋白质之间专一性的交互作用也往往由这些domain／motif介导的。Coiled coil就是其中一个介导蛋白质专一性相互作用的domain。为了系统地了解coiled coil之间专一性的相互作用，我们发展了计算和实验相结合的多步骤的方法。第一步，从酵母(saccharomyces cerevisiae)蛋白组中识别含coiled coil的蛋白，称为coiled-coil蛋白；第二步，从已知的酵母蛋白质相互作用网络中抽提一个coiled-coil蛋白间交互作用网络；第三步，以该网络为基础用SVM方法预测coiled coil的相互作用，第四步，应用大规模酵母双杂交实验方法(yeast two hybrid)验证该可能的相互作用。我们共分析和检测了4149对交互作用，得到478对阳性结果，包含在202个coiled-coil domain中。我们对其中的coiled coil domain进行功能分析，当把参与甲硫氨酸代谢途径的coiled coil进行敲除(knock out)时，酵母表现出甲硫氨酸营养缺陷，这表明了coiled coil在该生物途径中具有重要功能。同时我们发展体内外系统分析coiledcoil相互作用的方法，以探索生命网络是如何在domain水平上构建的。