候选基因多态性与肉鸡生长,采食量和饲料转比率的关联分析

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haoge2919
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鸟类的生长、采食量与饲料转化率受多种遗传因素的影响。本研究在9个与体重(BW)、体增重(BWG)、采食量(FI)和饲料转化率(FCR)相关的候选基因(LEPR,PRKAB1,PRKAG2, PRKAG3,MTOR,PDPK1,NPY6R,INS与GH1)中选取了49个SNP,对来自两个品系(N202和N301)的共796只已知系谱的雄性黄羽肉鸡进行基因型检测,其中22个SNP通过了基因型质量控制。另外,本试验分别测量了个体的49日龄(BW49)和70日龄(BW70)的体重,以及49至70日龄之间的采食量。体增重和饲料转化率通过49至70日龄之间的体重与采食量计算得出。SNP位点与表型性状的关联分析结果如下:1.对于LEPR,结果表明rs14657368与两个品系中的体增重和饲料转化率都存在显著相关(P<0.05),rs13684613和rs14657336与两品系中的采食量均存在显著相关(P<0.05)。两品系中显著相关表现出的一致性,证实了这一结果。虽然rs13684616与两品系的采食量均存在相关(P<0.05),但是却具有相反的基因效应。而某些SNP-性状关联只在一个品系中检出:rs13684613、 rs14657336、rs13684616和rs13684623只与N202品系的体重存在显著相关(P<0.05),而rs14657368只与N301品系的体重存在显著相关(P<0.05)。此外,rs13684623只与N202品系的采食量存在显著相关(P<0.05),rs13684615只与N301品系的采食量存在显著相关(P<0.05),rs13684616只与N301品系的饲料转化率存在显著相关(P<0.05)。另外,rsl4657336、rs13684613、 rs13684615和rs13684616处于连锁不平衡状态(LD),单倍型关联分析表明基于这四个位点的LD域与N202品系的体重和采食量、N301品系的饲料转化率存在显著相关(P<0.05)。2.PRKAB1中的rs14094358和rs14094362只与N202品系的体重、体增重和采食量存在显著相关(P<0.05),rs14094361只与N301品系的采食量和饲料转化率存在显著相关(P<0.05)。rs14094363只与N301品系的饲料转化率存在显著相关(P<0.05)。对于PRKAG2来说,上述4个SNP只与单个品系的性状存在相关,这些SNP的基因型效应同样具有品系特异性。3.PRKAG2中的rs14133282只与N202品系的采食量存在显著相关(P<0.05),rs13535812只与N202品系的体重存在显著相关(P<0.05)。这些单一SNP的基因型效益具有品系特异性。4.PRKAG3中的rs13595570与N202品系的体重存在显著相关(P<0.05)并且与N301品系的采食量和饲料转化率存在显著相关(P<0.05)。结果说明这两个SNP的基因型效应具有品系特异性。5.rs14284557(mTOR)只与N202品系的采食量存在显著相关(P<0.05)。这种关联说明此单个SNP的基因型效应具有品系特异性。6.PDPK1中的Snp.23.302.41339.S.1和rs14075742与两品系的体重均具有显著相关(P<0.05)。这种显著相关在两个品系中表现出一致性,证实了这一结果。虽然Snp.23.302.41339.S.1和rs14075742与两品系的采食量相关(P<0.05),但是却表现出相反的基因效应。此外,Snp.23.302.41339.S.1和rs14075742只与N301品系的体增重存在显著相关(P<0.05)。因此,这两组体增重关联的单一SNP,其基因型效应具有品系特异性。7.NPY6R中的Snp.31.298.3106.S.1和rs14062577与N202品系的体重存在相关(P<0.05),rs14062576与N301品系的体重存在相关(P<0.05)。Snp.31.298.3106.S.1和rs14062576只与N301品系的采食量存在显著相关(P<0.05),rs14062577只与N202品系的采食量存在显著相关(P<0.05)。另外,Snp.31.298.3106.S.1只与N301品系的饲料转化率存在显著相关(P<0.05)。NPY6R的3个SNP只与一个品系中的性状相关。这些结果说明上述单个SNP的基因型效应具有品系特异性。8.在两个品系中rs13757636(INS)与采食量、饲料转化率和体重均存在显著相关(P<0.05)。这种显著相关在两个品系中表现出的一致性,证实了这一结果。9.GH中SNP-与性状的关联只存在于单一品系中,rs13401485确实与N301品系中的体重和采食量存在显著相关(P<0.05)。但是,Snp.101.6.287.S.1也与N202品系中的体重和采食量存在显著相关(P<0.05)。这一结果表明单个SNP的基因型效应存在品系特异性。总体来说,本次研究检测的9个基因的多态性(LEPR, PRKAB1, PRKAG2, PRKAG3, MTOR, PDPK1, NPY6R, INS与GH)与鸡的体重、体增重、采食量和饲料转化率存在相关。我们的发现证实了对调解生长,采食量和饲料转化率基因研究的重要性,并且提供了进一步探索的研究基础,检测到的多态性位点可能成为培育肉鸡的潜在遗传分子标记。
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