党的十八大明确提出“科技创新是提高社会生产力和综合国力的战略支撑,必须摆在国家发展全局的核心位置。”强调要坚持走中国特色自主创新道路、实施创新驱动发展战略。珠江三角洲作为我国改革开放的先行地区、重要的经济中心区域,积极响应国家战略,争当创新驱动发展排头兵,努力成为带动全国创新发展的引擎。珠江三角洲由广州、佛山、肇庆、深圳、东莞、惠州、珠海、中山、江门九大城市组成,是我国人口集聚最多、经济最具活力、综合实力最强的三大城市群之一,有着“南海明珠”之称,研究珠江三角洲的创新能力和创新效率,对促进珠三角创新发展、推动我国经济高质量增长具有很强的现实意义。以珠三角九市作为研究对象,选取2010-2018年产业转型升级的关键时期数据,构建珠三角创新能力和创新效率评价指标体系,运用熵值法、数据包络法对珠三角地区的创新能力和创新效率进行评价,以期能够系统把握珠三角地区创新综合实力,挖掘各市创新短板,为珠三角的区域创新发展提供参考。为了更好地研究和分析珠三角的创新水平,与已经跻身于6大世界级城市群的长三角地区进行比较。研究发现:珠三角地区的创新能力和创新效率随时间呈现上升趋势,但其内部存在较大的差异。创新能力方面,广州、深圳两个城市的创新基础完善,创新投入充足,创新产出显著,创新能力位居前列;东莞、佛山,各方面表现中等;惠州、中山、珠海、江门和肇庆,创新基础薄弱,创新主体研发投入不足,创新产出不显著,创新能力明显滞后。创新效率方面,珠海、东莞近两年的创新效率名列前茅,广州和深圳超出最优的投入产出规模范围,规模效率呈现衰退趋势;惠州市投入规模未达到最优配置规模,规模效率降低;江门市创新管理制度和技术应用较弱,纯技术效率持续下降;佛山规模报酬递减;中山和肇庆规模报酬递增。与长三角相比,珠三角地区的创新效率较高,但创新能力稍弱,主要因为珠三角各市的技术市场发展缓慢,科技成果转移转化水平落后。最后,基于上述评价结果,提出改善区域创新基础环境、突出企业创新主体地位、促进区域技术市场发展、完善区域协同创新体系等对策建议。