论文部分内容阅读
目的了解北京地区679株分枝杆菌临床分离株的基因型分布、主要流行特点,比较465株分枝杆菌间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和散在分布重复单位-数目可变串联重复序列(MIRU-VNTR)两种基因型方法试验结果的异同,分析北京基因型与耐药性的相互关系,从而探讨北京地区结核分枝杆菌的分子流行特点,分析结核分枝杆菌的耐药性特点及其同分子流行病学的联系,并评价两种基因分型方法。方法对收集的北京市679株分枝杆菌临床分离株进行Spoligotyping基因分型研究,其中的465株分枝杆菌同时运用MIRU-VNTR方法进行基因分型研究。用NatureEdge软件和BioNumerics软件将分型结果进行聚类分析。应用比例法药物敏感试验对268株结核分枝杆菌进行检测,最后将药敏结果结合流行病学资料进行分析。采用χ2检验比较不同组间结果的差别。结果在分离培养的679株菌株中,具有特异Spoligotyping指纹图谱的北京基因型菌株在北京地区分布达82.6%(561/679),为北京地区2008年主要流行的基因型菌株。未接种过卡介苗(BCG)的患者中北京基因型菌株占83.5%(240/269),接种过BCG的患者中北京基因型菌株占81.7%(384/470),两者差异无统计学意义。十种药物耐药性由高到低依次为丁胺卡那霉素(61.76%)、利福平(54.65%)、乙硫异烟胺(44.16%)、利福布汀(39.71%)、异烟肼(23.37%)、链霉素(22.22%)、左氧氟沙星(18.87%)、对氨基水杨酸(8.70%)、卷曲霉素(6.52%)、乙胺丁醇(4.71%)。北京基因型菌株耐药率为86.11%(186/216),低于非北京基因型菌株的耐药率93.18%(41/44),但二者差异也无统计学意义。Spoligotyping分型方法显示成簇菌株占所有菌株的93.93%(437/465),分73个基因型,MIRU-VNTR分型方法显示成簇菌株占所有菌株的22.37%(104/465),398个基因型。本地户籍成为菌株成簇的一个危险因素,OR值为1.90。VNTR方法对465株分枝杆菌的分辨率指数为0.9576。对北京基因型的分辨率指数为0.9547,同样显示了很高的分辨率指数。而Spoligotyping分型方法对465株分枝杆菌的分辨率指数0.4131,对北京基因型的分辨率指数为0.1430,低于MIRU-VNTR方法。不同的菌株和同一菌株在不同位点的MIRU-VNTR DNA指纹图谱呈现出多态性,各位点呈现的等位基因多态性有差异,多态性最高的位点是QUB-11b,多态性最低的位点为QUB-4156c。对北京基因型位点多态性分析也显示了相同的最高位点和最低位点。结论北京基因型菌株2008年在北京地区有广泛分布,为占绝对优势的菌株；北京基因型菌株与BCG接种无关,与一线、二线抗结核药物耐药无关；结核病患者中有部分是由于近期传播而引起的。MIRU-VNTR基因分型方法能够对Spoligotyping分型结果继续分型,分辨率指数要高于Spoligotyping分型方法。MIRU-VNTR分型方法对所有基因型和对北京基因型的分辨指数差别不大。Spoligotyping分型方法对北京基因型的分辨率指数较低。