IKZF4和PMEL基因CNV与白癜风的关联性研究

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:accpaccp1234
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研究背景:白癜风是一种较常见的复杂性皮肤疾病,表现为皮肤局部或泛发的黑色素脱失斑,以青壮年发病居多,治疗相对困难,严重影响患者的身心健康。目前认为,白癜风可能是由于机体免疫调节功能紊乱,导致皮肤黑素细胞功能或数量的部分或完全丧失,但其确切的病因与发病机制尚未完全阐明。遗传流行病学研究发现,白癜风具有明显的遗传易感性和家族聚集性倾向,提示遗传变异可能为白癜风重要的病因之一。人类的遗传变异可以是基因组序列的改变,也可以是不影响基因组序列的结构改变,其中CNV(copy number variation,拷贝数变异)被认为是结构变异的一种形式,涉及由非等位基因同源重组引入的复制、缺失和复杂多位点变异组成的DNA大片段(>1.0 kb)拷贝数的变化。近年来,CNV已被视为个体间变异的遗传标记,用于研究人类基因组多样性与疾病的关联性。例如,CNV与自闭症、精神分裂症、癌症及自身免疫性疾病等的关联性已有愈来愈多的文献报道。关于白癜风的CNV研究,已报道C4A的<2拷贝可能与GD患者合并白癜风相关。课题组利用白癜风GWAS,鉴别出新的易感位点12q13.2。该区域包含两个重要候选基因PMEL和IKZF4,但PMEL和IKZF4基因CNV与白癜风的关联性尚无研究报道。本实验在前期工作的基础上,进一步探讨PMEL和IKZF4基因CNV与白癜风之间的关联性,以期为揭示白癜风的遗传学分子病因寻找新的突破口。研究目的:探讨IKZF4和PMEL基因CNV与白癜风发病的关联性。研究方法:收集1101例病例和1101例健康对照,设计探针,并使用TaqMan Real-Time PCR系统进行基因拷贝数多态分析,利用SDS 2.4软件输出IKZF4与PMEL基因拷贝数,运用SPSS 19.0进行数据整理和结果的统计分析。研究结果:⑴携带有IKZF4基因拷贝数为2和>2的个体增加白癜风的发病风险(P=0.03,OR=1.30,95%CI:1.07-1.57;P=0.04,OR=1.31,95%CI:1.00-1.71),携带有IKZF4基因拷贝数<2的个体降低白癜风的发病风险(P=3.90×10-6,OR=0.53,95%CI:0.41-0.67);(2)携带有PMEL基因拷贝数为2的个体增加白癜风的发病风险(P=1.03×10-7,OR=3.03,95%CI:2.05-4.57),携带有PMEL基因拷贝数<2的个体降低白癜风的发病风险(P=4.69×10-8,OR=0.23,95%CI:0.13-0.38)。(3)携带有IKZF4和PMEL基因拷贝数>2的患者明显增加白癜风合并自身免疫性疾病的风险(P=3.49×10-4,OR=2.38,95%CI:1.47-3.76;P=0.006,OR=4.06,95%CI:1.38-10.77),IKZF4和PMEL基因拷贝数与白癜风其他临床亚表型无明显相关性(P>0.05)。研究结论:IKZF4和PMEL基因CNV与白癜风的易感性相关,且二者的CNV可能影响其疾病表型(白癜风伴发其他自身免疫性疾病),但与白癜风的其他表型,如发病年龄、性别、皮损面积、临床类型、家族史、同形反应无明显相关性。
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