目的:运用新一代高通量测序的方法描绘有龋和无龋的母亲与其12月龄的婴幼儿口腔微生物多样性的特征,并分析有龋和无龋的母亲与其12月龄的婴幼儿口腔微生物多样性的关系。方法:本研究在婴幼儿12月龄时纳入20对母亲及婴幼儿(暴露组10名有龋母亲及其婴幼儿和非暴露组10名无龋母亲及其婴幼儿),通过问卷调查收集母亲及12月龄的婴幼儿龋病相关的社会、行为等方面的危险因素,并收集母亲和婴幼儿的集合龈上菌斑生物膜样本,抽提全基因组DNA后,用16S r RNA基因V4-V5高变区为引物扩增后,运用Mi Seq测序平台测序。结果:本研究暴露组和非暴露组在龋病相关的社会、行为等因素匹配良好。测序深度和覆盖度良好,样本量设置合理。在3%的非相似度水平上暴露组母亲,暴露组婴幼儿,非暴露组母亲和非暴露组婴幼儿4组测序操作分类单元(OTU)种类分别有774,815,761和684种。微生物多样性Shannon指数表明两组的母亲之间或婴幼儿之间口腔微生物多样性无显著性差异(p>0.05);而Shannon指数又表明两组内的母亲和婴幼儿口腔微生物多样性均有显著性差异(p<0.05)。主成分分析也表明一致的结果。Shannon指数同时表明母亲和婴幼儿之间的口腔微生物多样性呈显著性正相关(r=0.656,p=0.002)。群落结构分析发现18种优势菌属占据口腔微生物的大部分,物种相关性分析表明菌属之间存在复杂的正相关作用,聚类分析未发现明显的有暴露组和非暴露组鉴别开的相关聚类。结论:本研究表明母亲的口腔微生物多样性对12月龄的婴幼儿口腔微生物多样性有整体影响,这一结果可能为早期儿童龋风险评估的微生物因素提供更科学的理论依据。