随着我国经济的快速发展,我国的财政支出呈递增趋势。随着财政支出规模的扩大,如何提高财政资金的使用效率成为一个迫切需要解决的问题。从2003年财政部展开财政支出绩效评价实践到现在为止,我国财政资金绩效评价体系还处在初期阶段,没有形成科学完善的评价体系。在此背景下研究事业单位专项资金项目绩效评价,提升项目的经济效益以及社会效益,同时也能够使我国事业单位财政更加完善。另一方面,我国水利项目建设的财政资金规模大,主要来源于国家财政拨款。2014年国务院总理李克强强调要在2020年前建设172个重大水利项目。水利项目资金使用效率的低下不仅会造成国家财政资源的浪费,也将影响我国水利事业的发展。本文以S事业单位水文测报项目为例,通过对事业单专项资金绩效评价情况的分析,发现现阶段事业单位对专项资金的绩效评价中存在的共性问题,据此对事业单位专项资金绩效评价提出优化建议。本文专项资金绩效评价研究有利于其他单位建设绩效评价体系,同时也能为相关部门决策提供一些参考依据。本文首先对专项资金、财政支出、层次分析法相关的资金绩效评价的研究文献,政策文件等进行了梳理与归纳。介绍了什么是事业单位专项资金绩效评价,总结了其目标、特点及绩效评价的理论基础。对S事业单位专项资金绩效评价的现状展开具体的分析,发现目前S事业单位在资金绩效评价中存在普遍性问题:绩效目标不明确、缺乏绩效评价前期工作,项目绩效评价指标体系不合理、绩效评价主体单一,绩效评价结果应用不充分;最后,本文根据相关的政策结合S事业单位的实际工作情况以水文测报项目绩效评价体系为基础,优化事业单位专项资金绩效评价体系。明确绩效目标是开展绩效评价的方向,加强绩效评价的全过程控制,优化绩效评价指标体系,运用层次分析法对指标进行赋值,可得出专项资金绩效评价评分表。引入第三方评价机构提高绩效评价结果的准确性,并建议事业单位增强绩效评价结果的运用。目前对事业单位专项资金支出的绩效评价涉及较少,绩效评价体系不完善,针对事业单位专项资金研究较少,丰富了事业单位专项资金绩效评价方面的文献,本文以S事业单位水文测报项目为研究对象,分析目前绩效评价体系存在的问题,为完善事业单位专项资金绩效评价提供建议。提高事业单位专项资金绩效评价体系的建设,在实践中能够更好的运用专项资金,进一步加强专项资金支出管理,强化支出责任,建立科学、合理的财政支出绩效评价管理体系,提高财政资金使用效益。