经过改革开放四十年的发展,生产粗放、高耗能、高污染,产业结构和布局不合理的问题也日益突出。我国愈发强调生态绿色的技术开发以及产品研发,经由供给侧的结构性改革为经济带来了新的增长点。另一方面,中国经济进入产业转型发展的新时期,如何转变国民经济的发展方式,实现我国产业结构的转型升级,为经济创造新的增长点、增长极、增长带,释放新的发展动力和激发新的增长活力,是我国政府目前面临的重大难题。基于这一背景,本文尝试从微观经济主体的角度出发,研究政府环境保护相关补助对企业全要素生产率的影响。文中利用2007-2016年的A股上市非金融企业面板数据来实证检验政府环境保护相关补助对企业全要素生产率的影响,并通过中介效应进一步探讨政府环境保护相关补助的作用机制。经过实证研究:(1)基准回归模型的实证结果表明,政府环境保护补助给样本企业带来了年均444亿元的经济损失;考虑到用工具变量法利用两阶段最小二乘法和倾向得分匹配法消除变量内生性后,政府环境保护补助给样本企业带来了年均1 539亿元的经济损失。(2)企业存在着“寻补贴”的诉求和行为,这一行为可能会挤占了其他业务、研发活动的资金,同时使得企业依赖补助中获得的超额利润,抑制了企业自我变革发展的动力。针对实证研究结果,本文给出如下政策建议:一方面,政府要完善环境保护相关补助发放的标准和准则,加强监管,抑制腐败寻租行为。另一方面,企业应当注重自身发展,避免“寻补助”行为和过度依赖补助,进而形成自身的核心竞争力。