现代高校试行的书院制，是随着高等教育改革不断深化而出现的新型人才培养模式，是一种基于全人教育理念，通过深入实施亲密互动、和谐相容的导学机制，充分发挥第一课堂通识教育和第二课堂学生社区育人功能的人才培养模式。当前，书院制人才培养模式已经在很多高校有所实践，并取得了一定的成果，它在管理模式、培养目标、活动组织及导师的设置上都表现出了一些新的活力和优势，作为新型人才培养模式的书院制逐渐成为教育体制改革关注的领域，也在大学生思想政治教育过程中发挥着重要的作用。本文以苏州大学敬文书院为研究对象，通过对敬文书院的实地调查研究了解到在敬文书院人才培养模式下，大学生思想政治教育主要面临以下挑战：一是如何消解“试点书院+双院并存”体制引发的困惑；二是如何充分发挥公寓社区载体的思想政治教育功能；三是如何充分发挥“书院通识”的思想政治教育功能；四是如何更好利用网络手段提升思想政治教育的实效性。这些挑战给敬文书院大学生思想政治教育带来一定的困难，如何有效应对这些挑战，提高书院大学生思想政治教育的实效性，成为敬文书院人才培养模式下重要的研究课题。笔者通过对国内外相关理论的研究以及对苏州大学敬文书院的实地考察，并结合敬文书院大学生思想政治教育面临的挑战，尝试性总结了敬文书院人才培养模式下顺利开展大学生思想政治教育的对策。主要包括：第一，建立健全两院共同育人机制；第二，推广普及书院制；第三，实施全程全员导师制；第四，构建以“3D工程”为核心的党建模式；第五，发挥公寓团建的思想政治教育功能；第六，在“三自教育”中落实思想政治教育；第七，把通识教育与思想政治教育相结合；第八，完善思想政治教育信息化手段。