知识经济时代,区域创新已成为区域经济增长的动力源泉和获取国际竞争优势的决定性因素。提高区域创新能力是区域经济发展的重点,其有效途径是提高区域创新系统效率。本文正是以区域创新系统为研究对象,以区域创新系统效率的提高为研究目的,进行了相关理论研究与实证分析。首先,对区域创新系统要素的结构、要素在系统中发挥的功能、要素间互动的内部机制及要素间互动联系进行了详细分析,并提出区域创新系统要素功能的发挥和要素间的互动联系共同组成了区域创新系统网络结构,而这种网络结构直接影响区域创新系统效率高低;然后,在科学地构建了评价指标体系的基础上,提出了运用DEA方法评价区域创新系统效率;最后,在论文实证分析部分,对全国31个省级行政区域创新效率进行了评价,并结合实证评价结果和论文理论研究,提出提高区域创新系统效率的对策建议,对构建和完善我国区域创新系统,提高区域创新效率,进而提高区域创新能力,推动区域经济发展,有重要的理论和现实意义。