与疾病相关的差异表达基因检测

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从人体所有基因中检测出与疾病相关的致病基因,是目前生物信息学研究的一个热点问题,这项研究对于疾病的预防和治疗具有非常重要的意义。传统的差异表达基因检测方法是假设致病基因的所有疾病样本都会被激发,这些被激发的疾病样本被称为异常点。一些新的差异表达基因检测方法,因为考虑到致病基因中所有疾病样本激发概率的差异性,所以假设致病基因的所有疾病样本中仅仅只有一个子集将会被激发成为异常点。因此与传统的差异表达基因检测方法相比,这些新的差异表达基因检测方法提高了性能。在本篇论文中,我们首先研究关于两组的与疾病相关的差异表达基因检测方法t-statistic、COPA、OS和ORT,然后研究关于多组的与疾病相关的差异表达基因检测方法F-statistic、ORF和OF,再通过TPR/FPR和FDR仿真实验生成的ROC曲线比较传统方法t-statistic与新方法COPA、OS、ORT的性能优劣,最后通过TPR/FPR和FDR仿真实验生成的ROC曲线和真实数据实验结果比较传统方法F-statistic与新方法ORF、OF的性能优劣。通过TPR/FPR和FDR仿真实验生成的ROC曲线和真实数据实验结果进行对比分析和性能评价,验证这些新的差异表达基因检测方法性能更好。
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