桃线粒体DNA多态性及其与抗寒性的关系

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通过建立桃叶线粒体DNA提取方法、利用PCR扩增和生物信息学分析等手段,对具有不同抗寒能力的桃品种间线粒体DNA多态性是否与抗寒性相关进行了探讨。寻找细胞质(线粒体)中与树体抗寒力紧密连锁的分子标记,对桃树抗寒的辅助选择育种及进一步提高对抗寒性进行早期鉴定及提高亲本选配的准确性具有重要意义。主要试验过程与结论如下:1.通过差速离心、蔗糖衬垫及线粒体超活染色的方法对桃叶片线粒体进行了分离,成功的从线粒体中得到了完整、可满足后续试验要求的线粒体DNA。该提取体系的建立填补了桃叶线粒体DNA提取技术的空白,为从核外遗传角度进行分子生物学研究工作奠定了基础。2.以经过2009年冬天自然筛选的有明确抗寒分级的21个品种(珲春桃、贵州毛桃、GF677、曲枝山桃、瑞光27号、早霞露、奉化玉露、中华寿桃、阳泉肉桃、吉林8701、吉林8801、Mafim、寿红、红港、Vallegrande、Desert Red、五月火、中宁3号毛桃、深州白蜜、黄金蟠桃、青丝)的桃叶片为试材,用PCR扩增与直接测序法对线粒体DNA上的atp9、atp4(orf25)、coxI、coxIII、18s-5srRNA、ssu、nad4 exon1/2部分基因序列进行扩增与测序分析,寻找特异基因片段的多态性与品种抗寒性的关系。结果表明:在首次得到的桃线粒体DNA atp9、atp4(orf25)、coxI、coxIII、18s-5srrna、nad4 exon1/2部分基因序列与氨基酸序列基础上,发现除ATP9基因片段外,其余基因的序列均一致。3.位于atp9基因序列开放性阅读框上游非编码区的-96 bp~-94 bp处G碱基的缺失与否,可将桃抗寒与不抗寒品种区分开来,准确率达81%。推测G碱基的缺失可能影响到atp9基因转录过程中产生的单链RNA结构或atp9基因表达的调控。
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