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新疆野生核桃(Juglans regia)即为我国栽培核桃的直系祖先,它是属于胡桃科、胡桃属植物。在我国主要分布于新疆伊犁巩留野核桃沟内,是我国极为珍稀的野生自然资源。但其在构建遗传连锁图谱及利用分子标记辅助育种方面,明显滞后于其他野生果树树种,目前,国内尚未有关于其图谱构建的报道。对选取的F1野核桃资源开展表型性状,分子标记遗传多样性及关联分析检测和评价,并采用DNA标记构建野核桃分子连锁图,将为新疆野核桃今后展开相关农艺性状的基因精细定位、QTL以及MAS选择育种等奠定科学基础。本研究以野核桃沟的野核桃母本与父本及其杂交的F1代为作图群体,利用SSR和SRAP对适宜于野核桃反应体系优化筛选,性状调查关联度分析,以及标记的分离遗传分析等方面进行了研究,制作出了目前首张新疆野核桃分子连锁图。并且对其株高、茎粗以及最大叶长等相关性状分析研究。具体研究结果如下:1.本研究选取两棵长势较好且表型性状差异较大的野核桃树(父本:平底圆核桃,母本:椭圆核桃)进行人工授粉杂交,得到368株F1代个体,并在苗期测定了F1代的8个相关数量性状。2.对SSR和SRAP标记进行筛选,从115对SSR标记中筛选出46对在双亲间多态率较高的引物作用于群体间的分离分析检测,共获得70个多态性位点标记。从100对SRAP引物组合中筛选出17对多态率较高的SRAP引物对构图群体进行分析检测,共获得39个多态性标记位点。本试验共检测出109个多态位点可用来进行后续的构图分析。3.运用Joinmap4.0对检测出的109个标记位点进行连锁图构建,获得了一张包含有29个SSR,33个SRAP标记的新疆野核桃遗传连锁图,该图共涉及到15个连锁群,总长即为757.5 cM,各连锁群长度散布在22.1 cM-151.7 cM之间,平均图距即为12.22 cM,且每一连锁群上标记数量2-13个均有不等,其中检测出的偏分离标记共有13个,占21%。4.对选取的368份野核桃资源展开展表型性状、SSR、SRAP遗传多样性及其亲缘关系检测和评价。8个相关表型性状的特征值在群体中呈现出持续性散布,与其整个正态分布曲线拟合度较好,相互之间都具有较为紧密的关联度。其变异系数说明各性状变异均超过10%,表明个体之间的表型差异值变异较大。极为丰富多样的遗传变异性为新疆野核桃遗传改良及其分子育种提供了根据。