由于鲸类是经济价值巨大的海洋资源，人类对其进行了大规模的商业猎杀。同时，由于其栖息地的破坏、减少和环境的恶化，一度使得某些物种濒于灭绝。鲸类数量的急剧减少引起了科学界的广泛关注，开展了一系列例如鲸类种群数量的调查和监测、鲸类搁浅网络的建立、鲸类误捕和偶然死亡原因的调查以及鲸类体内有毒物质的研究。80年代以来，随着分子生物学的迅猛发展，涌现出一批分子进化和种群遗传分析方法和技术，而这些技术也很快地被引入到鲸类保护生物学领域。本实验选用Cyt b基因序列作为分子标记，从分子生物学的角度对未知的鲸类骨骼样品进行了物种的鉴定，采用蛋白酶K消化法和苯酚／氯仿有机抽提法提取基因组DNA，并做了下述改进：骨粉在消化前用灭菌的纯水浸泡；消化液中蛋白酶K的终浓度提高至0.3mg/ml；有机抽提过程中苯酚：氯仿：异戊醇(25：24：1)抽提两遍，氯仿：异戊醇(24：1)抽提两遍。实验结果如下： 1.获得了样品V1、V2、V3、V5、R、Z1的基因组DNA，电泳检测呈现轻微片断化的迹象。 2.获得了样品V1、V2、V5、Z1的PCR扩增产物，电泳检测显示产物大小约为550bp。 3.测序获得样品V1、V2、V5、Z1的Cyt b基因部分序列，并且样品V2、V5、Z1的序列完全相同，为同一单倍型。 4.GenBank比对结果如下：样品V1与大村鲸的相似度最高，达99﹪；样品V2、V5、Z1与大西洋小须鲸的相似度最高，达98﹪。初步推断样品V1为大村鲸，样品V2、V5、Z1为大西洋小须鲸； 5.基于UPGMA法和NJ法构建的系统发育树均表明样品V1的Cyt b序列与大村鲸的同源序列聚类，置信度达100﹪；样品V2、V5、Z1的Cyt b序列与大西洋小须鲸的同源序列聚类，置信度为100﹪。支持GenBank的比对结果。 6.MEGA软件分析结果表明样品V1的Cyt b序列与相似度最高的大村鲸单倍型(登录号AB201257、AB201256)存在1～2个核苷酸差异，成为一个新的单倍型，这是我国南海的首次记录；样品V2、V5、Z1的Cvt b序列完全一样，为同一单倍型，但与相似度最高的大西洋小须鲸单倍型(登录号AJ554054)存在7个核苷酸差异，成为一个新的单倍型。