对事业单位预算管理的系统性研究,不管是理论上还是实践上都没有足够的研究成果可以借鉴,本文试图构建一个指导事业单位预算管理的理论框架,据以评判事业单位预算管理的成效,探讨亟需解决的问题及成因,设计预算管理指标评价体系,以期能够为国内事业单位预算管理工作的顺利开展提供一些借鉴。目前已有的关于预算管理的文献中,从整体透视预算管理改革的角度来探索单位预算改革将何去何从的研究还很鲜见。因此,本文选择了“预算改革”这一角度对构建适应财政体制改革要求的事业单位预算进行系统的研究。结合本单位的实际情况,分析找到一条适合事业单位预算管理改革的道路。在研究方法上主要采取了演绎推理、规范研究、实证分析与案例相结合、定量与定性分析相结合的方法。以演绎推理为主,通过对国内外关于预算管理问题的研究推断处在改革过程中事业单位预算应当具备的特征及改革的方向。而不是仅仅通过有限的简单归纳就得出结论。对事业单位预算改革历程的分析,对NY科学院预算管理模式及存在问题的研究采用的是案例分析的方法,而对案例单位部门预算管理中存在的问题的原因则采用了实证分析的方法,通过设计调查问卷,使用统计研究分析模型,得出影响预算管理质量的变量。从而寻找提高事业单位预算管理水平的方式方法。传统上对预算管理的研究主要采取的是定性研究,定量分析鲜有涉及。为弥补这一不足,本文在定性分析如何提高事业单位预算管理水平的同时,试图构建事业单位绩效预算评价体系。结合定量分析,进一步对预算管理改革进行了定性分析,在总结改革基本经验的基础上,剖析成因寻找提高事业单位预算管理水平对策。本文的创新点表现在：运用预算管理的理论对NY科学院预算管理中存在的问题进行分析,根据实际工作经验设计调查问卷,采用调查问卷及专题访谈的形式获得第一手资料,归纳分析出事业单位预算编制、执行、监督等各个环节存在问题的成因,从而探索事业单位预算管理的方式方法,改进NY科学院预算管理过程中的不足,使单位预算管理体系更加具有科学性和实用性。对于在事业单位中的推行绩效预算管理提供有价值的参考。