蛇源ST516型嗜水气单胞菌鉴定及其对粘菌素耐药机制研究

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本研究以一起规模化蛇场爆发“高致死性腹泻病”为突破口,经生理生化和16S r RNA鉴定,证实从患病蛇脏器中分离的细菌为嗜水气单胞菌;分离菌的MLST基因分型显示分离菌为全新的基因型,经申请获得6个全新的序列号:gyr B-380、gro L-369、glt A-383、met G-374、pps A-414、rec A-406,结合6个序列号得到新的基因型ST516。蛇回归试验证实分离的ST516型A.hydrophila为蛇高致死性腹泻的病原菌,并且KM小鼠攻毒试验表明ST516型A.hydrophila不仅对小鼠具有高致死性,而且还可以引起小鼠出现腹泻症状,为潜在的人畜共患菌。应用体外药物诱导方法,将colistin敏感菌WCX23(colistin MIC=1μg/m L)诱导产生colistin耐药菌23-C-23(colistin MIC=256μg/m L)。全基因测序和比较基因分析显示细菌可能携带570个毒力基因,296个耐药基因,并且mla F基因出现非同义突变(518 A>C),该位点是从13代传代菌(23-C-13)开始出现突变,并稳定遗传至23代传代菌(23-C-23)。转录组学研究表明,显著上调基因主要参与丙酸代谢、阳离子抗菌肽耐药过程、ABC转运、细菌分泌系统等通路;显著下调基因主要参与甘油脂质代谢、甘油磷脂代谢、精氨酸生物合成、嘌呤代谢等通路。为探究hypothetical protein“gene1038”在嗜水气单胞菌耐colistin过程中的耐药机制,应用软件预测gene1038结构,通过基因敲除技术在23-C-23中敲除gene1038,随后回补Δgene1038,并对23-C-23和23-C-23:Δgene1038进行转录组学分析。结果发现gene10388携带8个跨膜区,与气单胞菌属有100%-86.81%的相似性,与其他种属细菌也仅66.4%甚至更低的相似性,在敲除gene1038后细菌对colistin的MIC值由256μg/m L下降至32μg/m L,回补gene1038后colistin MIC值又回升至256μg/m L。为探索env Z/omp R二元调节系统在嗜水气单胞菌耐colistin过程中的耐药机制,通过基因敲除技术在23-C-23中敲除env Z/omp R,随后回补Δenv Z/omp R,对23-C-23和23-C-23:Δenv Z/omp R进行转录组学分析。结果表明,当敲除env Z/omp R后colistin的MIC值由256μg/m L下降至8μg/m L,回补env Z/omp R后colistin MIC值又回升至256μg/m L。本研究是国内外首次对人工养殖蛇的高致死性传染病进行系统深入研究、分析,并证实ST516型嗜水气单胞菌为蛇高致死性腹泻病的病原菌;首次发现gene1038为气单胞菌属特有基因,并证实假定蛋白gene1038参与嗜水气单胞菌耐colistin并发挥着重要作用,推测该基因通过跨膜运输将colistin排出细菌体内,参与细菌对colistin耐药过程,且该基因具有colistin耐药具有专一性;首次证实了env Z/omp R二元调节系统在嗜水气单胞菌耐colistin过程中发挥重要作用且具有专一性,推测env Z/omp R调节操纵子arn BCADTE,通过L-Ara4N对外膜上的lipid A进行修饰,使得嗜水气单胞菌对colistin产生耐药。本研究为日后蛇场重大疾病净化提供有效的参考依据,并为阐明嗜水气单胞菌耐药机制的研究和日后药物防控奠定了重要的研究基础。
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