小额信贷是一个健全的金融系统中不可或缺的一环，目前我国的扶贫小额信贷业务主要面向的是贫困人群、中低收入人群以及小微企业，虽然具有政策背景，但是要实现扶贫小额信贷机构的可持续发展，机构还需向商业化和制度主义方向转变。要促进扶贫小额信贷的可持续发展，就必须使其能够通过正常的经营活动获取必要的利润，要达到这一目的，关键是要确定什么样的利率水平和机制有助于实现小额贷款业务的可持续发展和借贷双方的双赢。可持续的小额信贷机构，其成功的原因不仅仅是可持续的利率水平，更重要的是利率背后的运作机制，可持续的利率水平是小额信贷机构成功的关键，也是可持续运作机制的必然结果。本文以小额信贷机构可持续发展利率水平的估算作为切入点，根据①不同类型模式；②财务数据的可获得性；③机构运作的成熟程度，这三点标准选择了三家小额信贷机构即中国扶贫基金会小额信贷部暨中和农信项目管理有限公司、四川仪陇县乡村发展协会以及浙江泰隆商业银行作为研究样本，进行详细的案例对比分析。分析过程中使用收支平衡模型和Rosenberg模型对三家小额信贷机构的可持续利率水平进行估算，在估算结果的基础上，结合机构自身的基本情况和运作机制模式所具有的特点进行一系列对比分析，得出的分析结论认为扶贫小额信贷机构的商业化是实现其财务独立、提高经营管理效率、降低成本从而实现可持续发展的必由之路，验证了小额信贷由福利主义向制度主义转变的趋势。文章最后从政府和机构两个层面为扶贫小额信贷的可持续发展提出了建议。