自2013年12月国务院下发《关于全国中小企业股份转让系统有关问题的决定》起,新三板市场开始进入高速发展阶段,挂牌公司数量不断攀升。为了进一步加快我国“多层次资本市场”的推进工作,全国股转系统于2015年11月24日发布了《全国股转系统挂牌公司分层方案征求意见稿》,将所有新三板挂牌公司划分为创新层和基础层,以实现符合我国国情的“多层次,分步走”的发展战略规划。结合新三板“创新型、创业型、成长型”的服务定位,分层方案共设三套分层标准,从而筛选出市场所关注的不同类型的公司进入创新层。由于分层方案中的标准一与标准二涉及财务指标,具有较强的可操纵性,在实务中可能不乏部分公司实际运营情况未达分层标准,但希望通过进入创新层获取政策利好,为了实现自身利益而进行盈余管理。在此背景下,本文以新三板挂牌公司为研究对象,考察分层前后样本公司盈余管理程度变化情况,以及三套分层标准各自与盈余管理程度之间的关系,并通过探究做市商数量与盈余管理的关系提出分层标准的改进建议。本文得出以下结论:现行分层制度标准存在一定的不合理性,分层制度的标准一及标准二可能会促使部分公司通过盈余管理行为使各项财务指标达到标准从而进入创新层,而标准三中所包含的做市商数量可能可以较为有效地抑制企业盈余管理行为。同时,本文也将根据研究结果对现行的分层制度以及相关配套制度提出政策建议。