三种水稻检疫性病害同步分子检测方法的建立

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水稻白叶枯病(Rice bacterial leaf blight)、水稻细菌性条斑病(Rice bacterialleaf streak)和水稻细菌性谷枯病(Rice panicle blight)分别由白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzae)、细菌性条斑病菌(X. oryzae pv.oryzicola)和细菌性谷枯病菌(Burkholderia glumae)引起,并主要通过带菌种子进行传播。2007年,我国把这3种病菌列入进境植物检疫性有害生物名录。由于快速、灵敏和特异性强,普通PCR和实时荧光定量PCR(SYBR greenreal-time PCR)被广泛用于病害的检测。然而,针对X. oryzae pv. oryzae、X.oryzae pv. oryzicola、B. glumae这3种病原同步检测的体系仍未见报道。本论文分别根据水稻白叶枯病菌的糖基转移酶基因(putativeglycosyltransferase gene)(NCBI No. AF169030.1)、水稻细菌性条斑病菌的AvrRxo基因(NCBI No. AY395713.1)和水稻细菌性谷枯病菌16S rDNA的转录间隔序列(ITS)(NCBI No. D87080.1)进行特异性引物设计,结果表明3对引物特异性强,目标片段大小分别为230bp、112bp和164bp。对其灵敏度检测表明:常规PCR对X. oryzae pv. oryzae、X. oryzae pv.oryzicola和B. glumae DNA的检测最低限度分别为1pg/μl、0.5pg/μl和1pg/μl;实时荧光定量PCR对X. oryzae pv. oryzae、X. oryzae pv. oryzicola和B. glumaeDNA的检出限分别为1fg/μl、1fg/μl和10fg/μl。多重PCR可在一个PCR反应内实现对多种病菌的特异性扩增。本研究建立了对X. oryzae pv. oryzae、X. oryzae pv. oryzicola和B. glumae进行同步检测的多重PCR体系;对多重PCR灵敏度的检测结果表明,X. oryzaepv. oryzae、X. oryzae pv. oryzicola和B. glumae的检出限分别达到0.3pg/μl、0.167pg/μl和16.7pg/μl,与单独进行PCR的灵敏度接近。由于没有获得自然界中同时带有X. oryzae pv. oryzae、X. oryzae pv.oryzicola和B. glumae这3种病原菌的水稻种子,本研究对人工接种这3种病原的模拟带菌种子进行检测。结果表明,X. oryzae pv. oryzae、X. oryzae pv.oryzicola和B. glumae均能被检测到,且目的片段大小分别为230bp,164bp和112bp。综上所述,本研究建立了一种利用多重PCR技术对3种水稻检疫性病原进行同步检测的方法。该方法简单,快速,灵敏,可用于病原菌的快速检测领域。
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