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第一部分:CTLA—4基因多态性与Vogt—小柳原田综合征的相关性研究
目的:Vogt—小柳原田(Vogt—Koyanagi—HaradaSyndrome,VKH)综合征是一种累及全身多个系统、多个器官的自身免疫性疾病,典型表现为双眼的全葡萄膜炎、白癜风、脱发、毛发变白以及中枢神经系统症状。细胞毒性T淋巴细胞相关抗原—4(cytotoxicTlymphocyte—associatedantigen—4,CTLA—4)是一T细胞介导免疫反应的负性调节因子,研究发现其基因多态与多种自身免疫性疾病相关。本实验的目的是探讨CTLA—4基因的4个单核甘酸多态(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)与中国汉族人群VKH综合征的相关性。
方法:选择中国汉族人群209例VKH综合征患者和256例健康对照者,采集外周静脉血2-5ml,抗凝处理,提取基因组DNA,运用聚合酶链式反应(PolymeraseChainReaction,PCR)—限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)的方法,检测CTLA—4基因的4个SNP位点(-1661A/G,rs4553808;—318C/T,rs5742909;+49G/A,rs231775;及CT60,rs3087243),用SPSS10.0软件进行统计学分析,探讨上述4个SNP的多态性与中国汉族人群VKH综合征的相关性;用Haploview3.32软件以这4个SNP位点构建CTLA—4基因单倍体型,并比较VKH综合征和健康对照两人群中CTLA—4个单倍体型的频率差异。
结果:
1.CTLA—4基因+49G/A位点的G等位基因在VKH综合征患者中的频率显著高于健康对照(71.6%vs62.8%,p=0.0046,pcorrected=0.037,OR=1.141);该多态位点的基因型在VKH综合征患者和健康对照中的频率无差异(p=0.01,pcorrected=0.12)。
2.CTLA—4基因CT60位点的G等位基因在VKH综合征患者中的频率较健康对照组升高(81.8%vs76.4%,p=0.043),但经Bonferroni校正后差异无统计学意义;该多态位点基因型的频率在VKH综合征患者和健康对照中的差异无统计学意义(p=0.016,pcorrected=0.192)。
3.CTLA—4基因-1661A/G位点和—318C/T位点的等位基因及基因型频率在VKH综合征患者与健康对照中频率的差异无统计学意义。
4.利用Haploview3.32软件以这4个位点构建CTLA—4基因单倍体型,有3个单倍体型的频率在VKH综合征患者和/或健康对照中大于3%。单倍体型-1661A:—318C:+49G:CT60G在VKH综合征患者和健康对照组中的频率均最高,并且该单倍体型在VKH综合征患者中的频率显著高于健康对照组(70.1%vs60.0%,p=0.0013,pcorrected=0.021,OR=1.565)。单倍体型-1661A:—318C:+49A:CT60A在VKH综合征患者中的频率较健康对照低,但经Bonferroni校正后差异无统计学意义(15.7%vs21.2%,p=0.0349,porrected=0.584,OR=0.701).
结论:CTLA—4基因SNP+49G/A位点的G等位基因和CTLA—4单倍体型-1661A:—318C:+49G:CT60G与VKH综合征的易感性相关,提示CTLA—4的多态性与中国汉族VKH综合征易感性相关。
第二部分:CTLA—4基因多态性与Behcet病的相关性研究
目的:Behcet病是一种自身免疫性疾病,典型表现为复发性口腔溃疡、生殖器溃疡和复发性葡萄膜炎三联征和皮肤病变的,是我国最常见和最重要的致盲性葡萄膜炎之一。本实验的目的是探讨CTLA—4基因的4个SNP与中国汉族人群Behcet病的相关性,并利用荟萃分析(meta—analysis)探讨CTLA—4基因SNP+49G/A位点多态性与Behcet病的相关性。
方法:选择汉族人群228例Behcet病患者和207例健康对照者,采集外周静脉血2-5ml,抗凝处理,抽提基因组DNA,运用PCR—RFLP检测CTLA—4基因的4个SNP位点(-1661A/G,rs4553808;—318C/T,rs5742909;+49G/A,rs231775;和CT60,rs3087243),用SPSS10.0软件进行统计学分析,探讨上述4个SNP的多态性与汉族人群Behcet病的相关性;用Haploview3.32软件以者这4个SNP位点构建CTLA—4单倍体型,并在Behcet病和健康对照两人群中比较CTLA—4个单倍体型频率的差异。检索CTLA—4基因多态与Behcet病相关性研究的文献,利用荟萃分析评价CTLA—4基因SNP+49G/A位点多态性与Behcet病的相关性。
结果:
1.CTLA—4基因4个SNP多态(-1661A/G、—318C/T、+49G/A和CT60)的等位基因频率和基因型的频率在中国汉族Behcet病患者和健康对照组中的差异无统计学意义。
2.利用Haploview3.32软件以这4个位点构建CTLA—4基因单倍体型,有3个单倍体型的频率在Behcet病患者和/或健康对照中大于3%。单倍体型-1661A:—318C:+49G:CT60G在Behcet病患者和健康对照组中的频率均最高,但各个单倍体型的频率在Behcet病患者中与健康对照组的差异无统计学意义。
3.根据Medline检索的3篇关于CTLA—4基因SNP+49G/A多态与Behcet病相关性研究的文献数据以及本实验的数据,荟萃分析结果显示所有4个实验结果无异质性(p=0.60,I2=0%),CTLA—4基因SNP+49G/A多态性与Behcet病无相关性(overalleffects:Z=0.26,p=0.79),集合危险系数(pooledOR)为0.98(0.83-1.15)。
结论:实验研究提示CTLA—4基因多态性与汉族Behcet病无相关性。荟萃分析结果显示CTLA—4基因+49G/A位点的多态性与Behcet病无相关性。