长链非编码RNA 9130024F11Rik在小鼠脑发育过程中的作用初探

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近年的研究表明,人类基因组当中仅有1/5的转录与蛋白质编码相关,而其余大部分为非编码RNA。其中一类长度大于200核苷酸(nucleotide,nt)的非编码RNA,被称作长链非编码RNA(LncRNA,long non-coding RNA)。由于其具有调节基因表达的功能,引起了不少科研工作者的关注。同时,随着各个国家、地区的“脑计划”被纷纷提出,针对大脑发育过程的相关研究也层出不穷。大量现有研究表明,多种LncRNA参与到了脑发育过程中,包括神经元的分化、迁移,神经突触的建立,神经细胞的再生过程中。这些功能,也与大脑的正常发育过程息息相关。大脑的发育过程受到了多种因素共同精密调控。其中,SATB2蛋白作为一种能结合到核基质附着区的转录因子,在大脑发育过程中起到了十分重要的作用。SATB2蛋白可以使轴突延伸至胼胝体,确保大脑半球间神经冲动信号得以协同传递。同时,SATB2蛋白也参与到味觉形成以及长期记忆形成过程中。种种迹象表明,SATB2在大脑发育过程中具有十分重要的地位。在前期工作中,本课题组发现在小鼠Satb2基因上游的相反方向上,存在着一个名为9130024F11Rik的LncRNA。该LncRNA紧贴Satb2基因上游,且二者部分序列出现重叠。“艾伦大脑数据库(Allen Brain Atlas)”中的结果表明,该LncRNA在小鼠大脑、小脑以及肠中特异性表达。为了探究该LncRNA是否会在小鼠大脑发育过程中起到一定作用,本课题设计并构建了一个9130024F11Rik敲除鼠品系。最终,我们成功获得了该LncRNA的敲除鼠,并且经过初步检测,该敲除鼠的构建成功。之后,我们对敲除鼠形态学以及基因表达水平的检测,最终检测结果表明该LncRNA纯合子敲除鼠的9130024F11Rik以及Satb2基因转录水平相比野生型以及杂合子敲除鼠出现了降低的情况。并且,在小鼠出生后14天,成功检测到了小鼠大脑尺寸的变化。在此基础上,我们对LncRNA 9130024F11Rik在小鼠脑发育过程中的功能做出了一些推测。于此同时,通过观察P14时期小鼠全脑纵切切片,我们意外地发现在P14时期纯合子敲除鼠小脑中,外颗粒层几乎不存在。这一结果表明敲除鼠的小脑发育也存在一定的异常。由于之前没有SATB2蛋白在小鼠小脑中表达的相关报道,针对这一结果仍需更多实验进行探究。经过本课题的研究,我们成功构建了一个9130024F11Rik敲除鼠品系。在纯合子敲除鼠中,本课题成功观察到了小鼠大脑尺寸在出生后第14天变大的情况。通过切片以及尼氏染色,本课题还发现在敲除鼠小脑当中也存在发育过程上的异常。之后,通过对RNA转录水平检测,本课题也发现在敲除鼠中9130024F11Rik以及Satb2基因表达水平降低。结合这些观察到的现象,我们认为LncRNA9130024F11Rik在小鼠脑发育过程中起到了一定的作用。
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