尿毒症患者3’端非翻译区长度多态性研究

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尿毒症具有高患病率和高死亡率的特点。尿毒症病因复杂,症状可能长期隐蔽,在不同患者中症状表现多样,对不同人体器官组织的损害也不尽相同。尿毒症诊断时并非只根据血肌酐水平,还要多种辅助手段方可确诊。尿毒症的早期管理、诊断与治疗已经是全球关注的公共健康问题。目前对于尿毒症的预测、诊断及治疗方面的研究仍然有巨大的发展空间。目的:利用选择性多聚腺苷酸化位点测序技术(SAPAS)探究尿毒症发病机制。方法:选取10名尿毒症患者和10名健康人的外周血单个核细胞(PBMCs)作为实验样本,研究尿毒症患者外周血单个核细胞中mRNA上的3’端非翻译区域(3’UTR)长度多态性,并检测尿毒症患者和健康对照组之间差异基因的表达水平。采用定量逆转录聚合酶链式反应(QRT-PCR)对原始实验结果进行验证。结果:与健康人对照组相比,尿毒症患者有691个基因使用显著不同的3’UTR长度,其中475个基因使用较短的3’UTR,216个基因使用延长的3’UTR。一些3’UTR加长的基因和一些3’UTR缩短的基因会参与同一 GO功能项。在同样的GO功能项中富集的3’UTR基因的数目可能不同,富集基因的种类也不同。上调的差异表达基因792个,下调的差异表达基因252个。我们并未观察到的3’UTR基因非翻译区域长度与它自身表达量之间存在明显关系。结合生物信息学GO分析和KEGG分析发现3’UTR长度多态性与尿毒症临床病症间的联系,发现这些基因涉及尿毒症发病相关的泛素介导的蛋白水解、胰岛素信号通路、B细胞受体信号传导途径、Notch信号传导途径、细胞凋亡、肌动蛋白细胞骨架调节、血管平滑肌收缩、凝血调节等功能通路。这些通路上富集的差异基因不仅影响尿毒症患者的肾功能,也参与了并发症引起的其他组织器官的受损病变。验证结果符合原始测序结果。结论:3’UTR长度多态性与基因功能之间存在复杂的调控关系,3’UTR参与miRNA、结合蛋白等物质介导的基因表达调控。分析尿毒症患者和健康对照间显著差异的3’UTR长度以及差异表达的基因功能,是研究尿毒症的发病机制的一种新角度。本实验在全基因组水平研究3’UTR长度多态性,筛选出一些差异基因,可以为尿毒症的早期诊断、预后、靶向治疗等提供潜在的生物标志物,并为其对症治疗提供基础研究的初步依据。
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