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本论文的第一部分： 研究材料是MAGIC群体的12个亲本和206个后代株系。86对SSR分子标记共检测到了302个多态性条带，平均每个位点的多态性条带数为3.5个；4对多态性高的SSR标记便可以区分12个亲本，14对SSR标记可以区分206个后代株系，群体中每个SSR标记平均区分15个基因型。86对SSR标记对亲本与后代的带型检测结果，可概括为以下6种情况：简单保持型，占16.3％；重组替换保持型，占3.5％；简单增加型，66.3％；重组增加型，9.3％；重组丢失型，2.3％；简单丢失型，2.3％。可见MAGIC群体基因分离、重组的几率提高了，具有丰富的遗传多样性。MAGIC群体的86对SSR分子标记基因型与株高、抽穗期表型值的统计分析表明：有13对标记方差分析、与抽穗期的关联都达到显著水平，其中5对标记己被前人用于定位抽穗期QTLs：2对SSR标记方差分析、与株高的关联都达到显著水平，其中1对标记己被前人用于定位抽穗期QTLs；利用遗传多样性信息值(PIC值)较高的14对分子标记对MAGIC群体进行聚类分析，结果显示MAGIC群体在0.8的相似系数时基本不能聚类，在0.57相似系数时聚成25类，且亲本均匀分布其中。以上结果表明，MAGIC群体可用于基因定位作图且具有较好的群体结构和良好的遗传均衡性。 本论文的第二部分： 研究材料是MAGIC群体12个亲本以及后代中株高、生育期差异较大和差异较小的44份，总共56份材料。水稻是集中收获的作物，对于MAGIC种群育种，即多基因型遗传育种，要解决的首要问题是：如何保证多基因型品种内的多个纯合基因型的光温生态响应达到基本的一致性。快速鉴别不同品种(基因型)对不同生态区的适应性强弱的方法和技术还鲜有研究。本论文对水稻MAGIC群体的生态响应特性进行分析，将株高和生育期两方面的田间表型性状的数据进行方差、相关及回归等统计分析，其结果表明：相对于晚造，早造熟始株高差小且株高范围一致可作为弱响应材料选育的标准；早造第四节间可作为衡量水稻品种的光温敏感性的指标；同一生态区，利用显著反比关系可以用晚季的成熟-抽穗天数差来推测两季成熟天数差，从而判断适应性强弱；从56份水稻材料中选出了若干份生态强响应和弱响应的典型材料，以供下一步进行生态响应基础研究。