筛选并验证LOX和ACSL5作为胰腺癌预后预测的潜在生物标志物

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jshajhb1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的:胰腺癌的发病率在恶性肿瘤中居第14位,而死亡率高达第9位。目前,手术是胰腺癌治疗的主要手段。但由于胰腺癌早期阶段并没有明显的特异症状,患者就医时往往较晚,而同时胰腺癌具有高转移和高侵袭性、易出现化学治疗耐受等特点,严重影响了患者的治疗效果。尽管双药或三药联合疗法和新辅助治疗不断发展,但多年来胰腺癌患者5年生存率在2%到9%之间,始终没有得到显著改善。因此,采取何种指标作为参考,采取更为精准的治疗策略,已成为当前研究的热点方向。近年来,高通量分析在早期诊断、药物靶点、预后预测等生物标志物的筛选中发挥着重要作用。虽然对胰腺癌生物标志物的研究已受到广泛关注,但仍需进一步筛选具有胰腺癌预后预测能力的生物标志物并优化相关预测模型。内容与方法:本研究中,纳入2008年-2015年于天津医科大学肿瘤医院确诊并进行手术治疗的99名胰腺癌患者。基于无进展生存期(Progression-free survival,PFS)对患者进行分组,其中PFS>18个月作为预后良好组,PFS<12个月的作为预后不良组。在以上两组中各选3例,采用全基因组表达芯片分析两组间的差异表达基因(Differential gene expression,DEGs)。选取68例具有完整预后资料的胰腺癌患者,利用q RT-PCR考察候选基因表达水平与患者生存的相关性,进一步优选具有预后预测潜能的生物标志物,并利用免疫组化在蛋白水平上进行验证。随后,利用多变量分析所得潜在生物标志物和淋巴浸润、肿瘤分期等临床病理参数以及与患者生存的关系。最后,分别利用TCGA数据库和STRING在线工具考察所得潜在生物标志物影响胰腺癌进展的潜在机制。结果:(1)通过基因表达谱芯片分析在预后良好组和预后不良组的胰腺癌患者样本中筛选获得178个DEGs,在预后良好组中发现110个基因表达上调,68个基因表达下调。(2)基于DEGs差异表达倍数和现有研究报道,选取其中24个候选基因进行q RT-PCR检测,分析这些基因的mRNA水平与患者PFS和总生存期(Overall survival,OS)的相关性,最终筛选获得4个候选生物标志物,其中LOX的高表达提示不良预后,而ACSL5、TOX3、SLC44A4的高表达提示预后良好。(3)采用免疫组织化学染色(Immunohistochemistry,IHC)及双向评分系统,定量分析候选生物标志物的蛋白表达与临床指标以及患者预后的相关性,LOX表达与淋巴浸润显著相关,ACSL5的表达与肿瘤T分期具有相关性;TOX3的表达与临床分期、血管侵犯均显著相关。同时,LOX高表达、ACSL5和TOX3低表达的患者明显具有较差预后。(4)利用Pearson相关系数进行多变量分析结果进一步表明LOX和ACSL5是胰腺癌的独立预后因素,具有预后预测的应用潜能。(5)利用TCGA数据库分析LOX影响胰腺癌进展的可能分子机制,结果提示LOX与HIF-1a以及上皮间质转化(Epithelialmesenchymal transition,EMT)指标具有显著相关性,利用STRING在线工具构建蛋白-蛋白相互作用网络,结果表明ACSL5可能影响脂质代谢相关通路。结论:在这项研究中,我们对预后良好和预后不良患者的胰腺癌组织之间差异表达基因进行分析,筛选发现LOX和ACSL5是胰腺癌预后预测的潜在生物标志物,其中LOX高表达提示不良预后,而ACSL5的高表达提示预后良好。结合患者临床病理特征和分子互作网络分析结果可以推测,LOX可能通过调控肿瘤EMT过程促进肿瘤的转移,而ASCL5可能通过影响脂质代谢而参与肿瘤进展。
其他文献
学位
中国工商银行股份有限公司(简称:工商银行)成立于1984年,历经34年的飞速发展,一跃成为全球最赚钱的商业银行。受益于境内利率机制和政策倾斜,工商银行利用其丰厚的资本、众多
磷酸铁是锂离子电池正极材料磷酸铁锂的重要前驱体,其形貌、结构和粒度分布等对磷酸铁锂有重要影响。目前工厂所生产的磷酸铁前驱体存在形貌不规整、粒度分布不均匀和振实密度不高等问题,故制备球形形貌和粒度分布均匀的磷酸铁前驱体是提高振实密度的关键。针对这一问题,本论文对高振实密度的球形形貌磷酸铁的制备过程进行了详细的研究。对原有工厂工艺的碱液浓度、滴加速率、原料铁离子浓度、反应温度、搅拌速度、磷酸根与铁摩尔
目的观察高三尖杉酯碱(HHT)和伊马替尼(IM)单用及两者联用对慢性髓细胞白血病(CML)细胞株K562及其耐药株K562/G01增殖和凋亡的影响并探讨其作用机制。方法1.常规培养K562及K5
21世纪随着计算机科学技术不断的发展,计算机科学技术已经在许许多多的科学领域(生物工程,医学可视化手术,仿生技术等)里获得了突破性进展,而不单单在本科学领域绽放光彩。在生物物
目的正确分类心律失常对心血管疾病的诊断和预防具有重要意义。在临床检查中,心电信号易受噪声的干扰,为心律失常的识别和分类增加了一定的难度,另外,由于心电信号数据繁多、心律失常类型繁多、形态复杂以及心脏病专家诊断的主观性等原因,传统诊断心律失常的方式效率低下,且容易出现漏诊误诊的情况。为了提高心律失常分类的效率、节约心脏病专家的诊断时间以及患者就诊时间,构建自动心律失常分类模型就显得尤为重要。而现有的
詹姆斯·科南特是美国著名的科学家、政治家和教育家,被誉为“20世纪美国最富有影响力的人物之一”,他参与了美国在第一次世界大战、第二次世界大战和冷战中的许多重大军事科技研发工作,发挥了十分重要的作用。对科南特在20世纪美国军事科技研发中的角色与作用的研究,有助于了解他作为科学家的代表在20世纪美国政治与军事舞台上所扮演的角色。科南特出生于美国马萨马萨诸塞州的多彻斯特小镇,接受过良好的家庭和中学教育,
随着全球经济的快速发展,化石燃料的枯竭和环境污染的加剧,迫切需要具有高效、清洁的特点的能源,并维持能源的合理,以及能源转换和存储相关的新技术。相比电池,超级电容器是
谷胱甘肽(GSH)是广泛存在于绝大多数真核细胞和许多细菌中的一类活性小肽化合物,由于具有解毒、抗氧化、抗衰老等多种重要的生理功能,GSH已经被广泛应用于制药、食品添加剂以及
乙烯是一种植物内源激素,其生理功能主要是促进果实成熟,同时也是果实腐烂的成因。可以通过使用乙烯吸附剂控制储存环境中乙烯的浓度,提高果蔬的货架寿命。乙烯吸附剂的种类