耕地生态环境保护的重要性是由耕地资源稀缺性的基本国情所决定的,在人口数量、资源利用、生态平衡多重发展矛盾和压力交织下,伴随着经济稳定、协调的新常态化发展,中国农业规模化、机械化和现代化进程的不断加快,农业化肥、农膜、农药的投入数量和施用强度不断提高,频现资源供需矛盾激化、土壤生态环境破坏、开发利用强度过猛等现象,直接导致耕地面源污染问题尤为严峻,而且在未来发展中还有不断恶化的趋势。中央一号文件连续14年聚焦农业粮食安全于首位,特别强调耕地资源数量、质量和生态保护的“三位一体”,尤其是加强面源污染防治力度和落实化肥农药零增长行动。加快农业供给侧结构性改革,转变农业发展方式,对耕地面源污染进行生态风险分析与评估,才能更好地使“创新、协调、绿色、开放、共享”的发展新理念贯彻落实,形成农业资源高效利用、农业生态系统平衡、农产品绿色安全的现代农业新格局。本研究基于负外部性理论、公共产品理论和环境风险管理等相关理论,在实地调研数据、昌吉州历年面板数据和耕地的时序监测数据的基础上,以新疆昌吉州耕地作为研究区域和对象,通过对新疆昌吉州耕地化肥、农药、农膜等面源污染风险源数量和分布进行调查分析,确定污染源与耕地的相互关系,确定当前污染水平下评价区域内耕地资源的空间分异规律。文本亦通过对引起昌吉州耕地面源污染的生态风险一系列相关基础数据进行质性研究和量化分析,掌握昌吉州不同县市耕地面源污染影响程度、状况差异及其变化趋势,通过分析不同地区耕地面源污染存在的差异化问题,探究结果背后的深层影响因素,初步构建预防和控制耕地面源污染源的防控体系,针对性地提出十条防控耕地面源污染的具体对策与建议,对于加快昌吉州耕地绿色可持续发展、循环高效种植具有重要的实践指导意义。结果表明:第一,造成新疆昌吉州耕地面源污染的化肥、农药、农膜的风险源数量、分布、影响程度及状况在2004-2014年时序段各有差异;第二,通过主成分-聚类-集对模型构建并实证分析评价耕地面源污染生态风险,得出新疆昌吉州耕地面源污染的风险等级及影响因素在空间上存在明显的分区差异化;第三,根据分析结果的相对风险层次情况,对于昌吉州各县市耕地面源污染生态风险防控,建立包括无间断垂直性刚性管控政策、全过程平行性柔性引导措施和公众主动参与监督的系统全面、纵横交错的防控体系。最后,在研究的基础上从宏观政府立场和微观施行视角提出十项具体的措施,以供环保、发改、农业、水利等有关主管部门用以参考和借鉴。